Shell 计算模式范围内的平均值

我对这类工作非常陌生，所以请容忍我：）我试图计算各种模式的平均值。例如，我有两个以制表符分隔的文件：

coverage.txt文件包含两个列。第一列表示位置，第二列表示分配给该位置的值。大约有4*10^6个位置

coverage.txt 
1 10 
2 30
3 5
4 10

第二个文件“patterns.txt”包含三列1。模式的名称，2。图案和3的起始位置。图案的结束位置。图案范围不重叠。大约有3000种图案

patterns.txt
rpoB 1 2
gyrA 3 4

现在，我想计算分配给不同模式位置的值的平均值，并将输出写入一个新文件，其中包含patterns.txt的第一列作为标识符

output.txt
rpoB 20
gyrA 7.5

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我认为这可以通过使用

awk

来实现，但我不知道从哪里开始。非常感谢您的帮助

有了400万个职位，也许是时候使用一种比shell/awk更丰富的编程语言了，但您可以通过以下方式一次完成：

awk '{
  if (FILENAME ~ "patterns.txt") {
    min[$1]=$2
    max[$1]=$3
  } else {
    for (pat in min) {
      if ($1 >= min[pat] && $1 <= max[pat]) {
        total[pat] += $2
        count[pat] += 1
      }
    }
  }
}
END  {
  for (pat in total) {
    print pat,total[pat]/count[pat]
  }
}' patterns.txt coverage.txt

awk'{
if（文件名~“patterns.txt”）{
最低[$1]=$2
最高[$1]=$3
}否则{
对于（帕特，以分钟为单位）{
如果（$1>=min[pat]&&&1