Unix grep-f仅返回第一个匹配（许多匹配中）

试图从命令行中获得更多信息：

我有一个文件：

CHR25   1192279 Y       Exonic  NA      exon    2       [1/1]   1192145 1192322
CHR25   1192279 Y       Exonic  NA      CDS     2       [1/1]   1192145 1192322  
CHR25   1739394 Y       Exonic  NA      CDS     2       [1/2]   1739294 1739456

我想得到基于第2列的唯一行。我已经做了

cat file | cut -f 2 | uniq > grepfile

但是我不确定现在如何使用

grep-f

获得每行一个匹配项。使用

-m1或| head-n1

仅给出第一条匹配行。我希望第一行与“grepfile”中的每一行匹配

---

期待答案=）

如果Perl还可以，您可以：

perl -nale '$h{$F[1]}=$_ if(!$h{$F[1]});END{print $h{$_}for(keys(%h));}' file

---

此awk命令通过构建已看到的第二个字段值的关联数组来工作

awk '!s[$2]++'

关联数组称为

s

。表达式查找$2（输入行的第二列）并应用postincrement，它将在第一次调用时返回0，之后返回非零。然后我将其反转，第一次看到每个$2时收益率为1，之后每次收益率为0。awk的默认操作是在选择表达式为true时打印

当行计数足够大，可以再次环绕到0时，请注意。

这也会起作用：

sort -u  -k2,2 file

给予：

CHR25   1192279 Y       Exonic  NA      exon    2       [1/1]   1192145 1192322
CHR25   1739394 Y       Exonic  NA      CDS     2       [1/2]   1739294 1739456

---

-u

调用

uniq

，

-k2,2

表示排序时可以看到的字段2上的排序（仅字段2）。

因为uniq只查看相邻行，排序会改变顺序。你需要多一点代码

cat -n input-file | sort --key=3,3 --unique | sort | cut -f2- >output-file

cat-n

添加序列号

sort--key=3,3--unique

删除字段2上的重复项。注意：由于

cat-n

，钥匙号高一个

排序

以恢复原始顺序

cut-f2-

获取序列号

---

那么您只需要示例中的第一行和第三行？还是第二和第三？哪一个重要吗？从这个问题上看，你想要实现什么并不清楚。根据您已经提供的示例输入文件添加您想要得到的最终输出，我相信我们能够提供帮助。我想我已经得到了。这是awk的工作<代码>awk'！s[$2]+'我只想为

grepfile

@AlanCurry中的每一行获得第一个匹配项，它工作得很好，我真的需要知道awkI可以在Perl中完成它（有更多的行），但我正在尝试使用命令行。不过还是要谢谢你。我可以用perl做这件事，几乎和我在awk中做的一样：

perl-nae'print if$s{$F[1]}++'

+1代表

awk

。。需要注意的是，如果使用

csh/tcsh

，则需要退出

，所以
awk'\！s[$2]+'
将起作用。+1很好的解决方案，但是如果多花几个字符使解释变得多余并避免溢出，该怎么办
awk的[$2]==0{s[$2]=1；print}'
-u和--unique表示unique，比如uniq。但是uniq命令没有被调用。@richard对，你是。。谢谢你指出这一点。我应该更仔细地查看手册页，我刚刚看到uniq*：）@user1495853不客气。如果本页上的任何解决方案有助于提高投票率，请随意投票。考虑选择你喜欢的和答案旁边的。这将奖励双方一些代表点，并将此问题标记为已解决。