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Algorithm 序列比较与移动块检测_Algorithm_Language Agnostic_Theory - Fatal编程技术网

Algorithm 序列比较与移动块检测

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我需要比较两个序列并找到编辑距离。编辑可以包括删除和插入操作(每个符号的修改权重为1)和块移动操作(每个符号的权重为0.1)
例如:
A B C D EF G H
F G HA B C Y D X E
块FGH已移到此处。
是否存在有效解决此任务的现有算法?

您可以尝试(通过):

使用“移动”的算法 操作员在P.Heckel中描述


(很抱歉使用scribd界面,但我猜纸张尚未进行OCR。)

是;有许多与生物学有关的算法和理论;基因组比对和染色体重排。在不了解数据的情况下,很难提及更具体的内容。我提到煎饼排序是另一种重新排列的方法,还有其他一些很好的选择(特别是压缩)。当然,这种方法无法将数据分割成块。处理小序列数据时,生成所有分组应该没有问题。

的摘要看起来很有希望。

哇。。。抄写很糟糕。我宁愿让AdobeAcrobat在我的浏览器中打开,也不要那个怪物。当然,我无意冒犯你,我只是从来没有使用过它,选择CiteSerx之类的东西。@nlucaroni:是的,我同意。如果你能在网上其他地方找到Heckel论文(全文)的链接,请发布。