Awk 删除带有sed和regexp的行

我有一个文件如下所示：

rs994321    -   chr6_ssto_hap7  712891  G   A   0.011180599999999999        0.0058201   62357
rs994321    -   chr6_mcf_hap5   675532  G   A   0.011180599999999999    0.0058201   62357
rs994321    -   chr6_mann_hap4  675338  G   A   0.011180599999999999    0.0058201   62357
rs994321    -   chr4_dbb_hap3   675681  G   A   0.011180599999999999    0.0058201   62357
rs994321    -   chr4_cox_hap2   891136  G   A   0.011180599999999999    0.0058201   62357
rs994321    -   chr6    29372356    G   A   0.011180599999999999    0.0058201   62357
rs9943219   +   chr1    238691947   A   G   0.00700761  0.00727069  62357
rs9943217   +   chr1    238691673   A   G   0.00663929  0.00715566  62357

我想删除带有模式

chr*\u*\ uhap*

的行。在我的示例中，应该只保留最后3行。我已尝试使用以下命令，但它们不起作用：

sed '/chr[0-9]_*_hap[0-9]/d' test.txt
sed '/*_hap[0-9]/d' test.txt
sed '/\*_hap[0-9]/d' test.txt

我不太擅长使用regexp

$ egrep -v '\bchr([^_]*_){2}hap[0-9]\b' data
rs994321    -   chr6    29372356    G   A   0.011180599999999999    0.0058201   62357
rs9943219   +   chr1    238691947   A   G   0.00700761  0.00727069  62357
rs9943217   +   chr1    238691673   A   G   0.00663929  0.00715566  62357

或使用

sed

：

$ sed -r '/\bchr([^_]*_){2}hap[0-9]\b/d' data
rs994321    -   chr6    29372356    G   A   0.011180599999999999    0.0058201   62357
rs9943219   +   chr1    238691947   A   G   0.00700761  0.00727069  62357
rs9943217   +   chr1    238691673   A   G   0.00663929  0.00715566  62357

$ awk '! /chr[^_]*_[^_]*_hap[0-9]/' data
rs994321    -   chr6    29372356    G   A   0.011180599999999999    0.0058201   62357
rs9943219   +   chr1    238691947   A   G   0.00700761  0.00727069  62357
rs9943217   +   chr1    238691673   A   G   0.00663929  0.00715566  62357

使用

awk

：

$ sed -r '/\bchr([^_]*_){2}hap[0-9]\b/d' data
rs994321    -   chr6    29372356    G   A   0.011180599999999999    0.0058201   62357
rs9943219   +   chr1    238691947   A   G   0.00700761  0.00727069  62357
rs9943217   +   chr1    238691673   A   G   0.00663929  0.00715566  62357

$ awk '! /chr[^_]*_[^_]*_hap[0-9]/' data
rs994321    -   chr6    29372356    G   A   0.011180599999999999    0.0058201   62357
rs9943219   +   chr1    238691947   A   G   0.00700761  0.00727069  62357
rs9943217   +   chr1    238691673   A   G   0.00663929  0.00715566  62357

---

完整且漂亮：-）REs末尾的

*

s不起作用，请将其删除。同样，从awk语句中删除

{print}

。regexp实际上应该是

chr[^]*.[^]*.\uhap

，以便更健壮，并且可以简化为

chr（[^]*.{2}hap

，以简化大多数命令。通常，您还应该添加锚和/或标识特定字段，但对于这种输入格式可能没有问题。