使用awk根据以前记录的计数更新特定列中的字段
我必须更新下面输入文件的第一个字段（不包括作为标题的前两行。BGL、GLC和LIN之前第一列中的数字是一个计数器，必须以这样一种方式进行更新，即对于具有相同分子BCL、GLC和LIN的每一系列记录，计数器增加一个 下面是我输入文件的一小部分（我有100个这样的文件）： 我希望将以下内容作为输出：使用awk根据以前记录的计数更新特定列中的字段,awk,text-processing,Awk,Text Processing,我必须更新下面输入文件的第一个字段（不包括作为标题的前两行。BGL、GLC和LIN之前第一列中的数字是一个计数器，必须以这样一种方式进行更新，即对于具有相同分子BCL、GLC和LIN的每一系列记录，计数器增加一个 下面是我输入文件的一小部分（我有100个这样的文件）： 我希望将以下内容作为输出： 900 mgdg molecules in water t= 600000.00000 step= 400000000 177255 1BGL C5 1 2.709 14.4
900 mgdg molecules in water t= 600000.00000 step= 400000000
177255
1BGL C5 1 2.709 14.491 1.493
1BGL H5 2 2.664 14.412 1.433
1BGL O5 3 2.717 14.464 1.627
1BGL C1 4 2.599 14.430 1.687
1BGL H1 5 2.546 14.350 1.634
1GLC O1 23 2.609 14.403 1.823
1GLC C1 24 2.675 14.276 1.837
1GLC H11 25 2.607 14.204 1.790
1LIN C3 44 3.033 14.281 2.268
1LIN H31 45 3.136 14.298 2.235
1LIN C3 87 3.108 13.927 2.066
1LIN H31 88 3.077 13.879 2.159
2BGL C5 1 2.709 14.491 1.493
2BGL H5 2 2.664 14.412 1.433
2BGL O5 3 2.717 14.464 1.627
2BGL C1 4 2.599 14.430 1.687
2BGL H1 5 2.546 14.350 1.634
2GLC O1 23 2.609 14.403 1.823
2GLC C1 24 2.675 14.276 1.837
2GLC H11 25 2.607 14.204 1.790
2LIN C3 44 3.033 14.281 2.268
2LIN H31 45 3.136 14.298 2.235
2LIN C3 87 3.108 13.927 2.066
2LIN H31 88 3.077 13.879 2.159
etc
900BGL C5 1 2.709 14.491 1.493
900BGL H5 2 2.664 14.412 1.433
900BGL O5 3 2.717 14.464 1.627
900BGL C1 4 2.599 14.430 1.687
900BGL H1 5 2.546 14.350 1.634
900GLC O1 23 2.609 14.403 1.823
900GLC C1 24 2.675 14.276 1.837
900GLC H11 25 2.607 14.204 1.790
900LIN C3 44 3.033 14.281 2.268
900LIN H31 45 3.136 14.298 2.235
900LIN C3 87 3.108 13.927 2.066
900LIN H31 88 3.077 13.879 2.159
etc
20389SOL OW77253 0.644 14.144 5.376
20389SOL HW177254 0.712 14.203 5.344
20389SOL HW277255 0.577 14.201 5.413
6.36535 23.37625 12.09434
#!/bin/bash
awk '
FNR==1{
++count
value=count"BGL" (or whatever)
}
{
$1=value
}
1
FNR%22==0{
++count
value=count"BGL"
}
' after_SOL.gro | tee after_SOL2.gro
#!/bin/bash
for num in {1..100};
do
(awk script here) eq4_$num.gro | tee eq5_$num.gro
done
我相信此脚本完全符合您的要求，并保留了输入的表格格式：
！/bin/bash
awk'
NR 2{
分（/[0-9]*/，“”，$1）；
如果（$1！=prev）{count[$1]+}
上一期=$1
printf（“%8s%6s%4s%7s%7s%7s\n”，计数[$1]$1、$2、$3、$4、$5、$6）
}'data.txt
！/bin/bash
awk'
NR 2{
分（/[0-9]*/，“”，$1）；
如果（$1！=prev）{count[$1]+}
上一期=$1
printf（“%8s%6s%4s%7s%7s%7s\n”，计数[$1]$1、$2、$3、$4、$5、$6）
}'data.txt
#!/usr/bin/gawk -f
BEGIN{ mol=""; prev=""; }
{
gsub(/[0-9]/,"",$1);
mol=$1;
if (mol==prev){
nr=m[mol];
}
else {
nr=++m[mol]
};
prev=mol;
print nr$0
}
m[]我希望这就是我们计划做的事情？这个脚本应该对分子重新编号
#!/usr/bin/gawk -f
BEGIN{ mol=""; prev=""; }
{
gsub(/[0-9]/,"",$1);
mol=$1;
if (mol==prev){
nr=m[mol];
}
else {
nr=++m[mol]
};
prev=mol;
print nr$0
}
m[]我希望这就是我们计划在哪里做的？你能用文字解释一下你的输入和输出之间的区别吗？是的，在我输入的第一列中：1BGL..2GLC..3LIN..4LIN..1BGL..2GLC..3LIN..4LIN..1BGL..2gl..2GLC..2LIN 3GLC..3LIN。在输出中，我想有1BGL..1GLC..1LIN 1LIN 1LIN然后是2gl 2GLC..3GLC..3L在Etcy中，如果您想对进行排序？，则不需要awk来进行排序……不，我不想进行排序。我想重命名每个原子中的第一列（每个原子都是一行）.排序在这种情况下是无用的，我有900个分子，所以我需要1个BGL/GLC/LIN，2个BG/GLC/LIN，3个BGL，GLC/LIN 4，5，6个BGL/GLC LIN等。现在我到处都有1BGL，到处都有2个GLC，到处都有3个LIN，到处都有4个LIN。但你是对的。也许首先我应该排序，这样我会有例如10000行BGL，然后是20000行BGLGLC和50000行LIN，然后我将使用脚本，我将其粘贴在这里，因此我可以使用例如（NR>=3&&NR您未能定义原子，但我猜它是“BGL”、“GLC”、“LIN”等。您能用语言解释一下您的输入和输出之间的区别吗？是的，在我输入的第一列中：1BGL..2GLC..3LIN..4LIN..再1BGL..2GLC..3LIN 4LIN再1BGL..2GLC..3LIN 4LIN在输出中我想要1BGL..1GLC..1GLC..1GLC..1GLC..1LIN 1n 2BGL..2GLC..2LIN然后3BGL..3GLC..3LIN等等如果您想
排序atom