Bash循环以搜索所有列

我有一个包含200000行和8k列的大型文件，希望在shell中使用循环或if语句逐个（按列）从每列中提取值“0/1”，并打印该列以及头两列

使用

awk

：

awk 'NR==1{split($0,arr,/ /)};
     NR>1{for (i=3;i<=NF;i++) if($i=="0/1") print $1, $2, $i, arr[i]}' OFS="\t" infile

产出将是：

1       2       0/1     C
1       2       0/1     F
1       2       0/1     J
0       1       0/1     K

---

欢迎使用stack overflow，请在代码标记中向我们显示示例输入和预期输出。根据数据的格式，您可以使用

cut

unix工具拉出您感兴趣的任何列。类似

cut-f1,3,4-d'，data.csv

的内容将返回第1、3和4列，用逗号分开。嗨，伙计们，谢谢你们的回答。。。。请注意，我有多个值，我只需要过滤“0/1”值，然后将该克隆与其他克隆一起打印。我无法指定第1列到8000列来查找值并进行剪切？然后您需要编写一个程序来遍历文件以确定它需要哪些列，然后实际打印这些列。Thx。我想要这个输入和输出文件的例子。请记住，我有8000列，因此无法指定列名输入：Chr Pos Sample1 Sample2 Sample3 1 568478 0/1 1 1/1 0/1 15 985612 0/0 0 0/1 1 1/1 4 412587 0/1 0/1 0/0 0 0/0 5 218663 0/0 0/1 1 1 1/1 Out Chr Pos Sample1 Sample2 Sample3 1 5684780/1不适用0/1 15 985612不适用0/1不适用4 412587 0/1 0/1不适用5 218663不适用0/1不适用

1       2       0/1     C
1       2       0/1     F
1       2       0/1     J
0       1       0/1     K