Bash 捕获一行代码的错误流，并使用trap报告它，同时保持标准输出不变

我在下面的2个shell脚本中尝试了以下（简化）代码

该脚本调用运行代码的R脚本，该脚本将根据发生的情况生成标准输出和错误流

我试图实现的是像往常一样在控制台上显示输出和错误流，但是当脚本运行并且失败时（例如，RScript生成错误流）我想保存R在sqlite数据库中生成的错误消息，但当它退出时，仍然会在控制台上显示正常的输出和错误。我已经尝试过多种形式的重定向Rscript函数的输出，但我要么最终不将任何内容保存到数据库（除了行号），要么可以保存错误消息，但控制台上不会显示任何内容

这不会将错误消息保存到DB（行号将为），但所有内容都将在控制台上

updateDBwhenError() {
    sqlite3 "myDB.db" "INSERT INTO logs VALUES('$1')"   
}

err_report() {
    #Tryign to capture both line error and message
    updateDBwhenError "Error Line $1 $2"
    exit
}
trap 'err_report ${LINENO}' ERR

Rscript testScript.R

这将把错误消息保存到数据库中，但控制台上不再有任何内容

updateDBwhenError() {
    sqlite3 "myDB.db" "INSERT INTO logs VALUES('$1')"   
}

err_report() {
    #Tryign to capture both line error and message
    updateDBwhenError "Error Line $1 $rErr"
    exit
}
trap 'err_report ${LINENO}' ERR

rErr=$(Rscript testScript.R 2>&1)

我到处寻找一种方法，只捕获变量的错误流，并在控制台上保持输出不变（包括输出和错误），但我被卡住了：）

格尔茨， PJ

试试这个

exec 5>&1
exec 6>&1
rErr=$(Rscript testScript.R 2>&1 1>&6 | tee /dev/fd/5)

测试脚本

$ cat test
#!/bin/bash
ls
ls sdfgds

使用此脚本进行测试

$ exec 5>&1
$ exec 6>&1
$ err=$(./test 2>&1 1>&6 | tee /dev/fd/5)
file  new_file  test  xml
ls: cannot access 'sdfgds': No such file or directory

$ echo "$err"
ls: cannot access 'sdfgds': No such file or directory

不久 使用未命名的FIFO（警告，这将起作用，因为操作系统进行缓冲，所以只有当输出保持在64Kb以下！），有一种微妙的方式：

并使用类似于：

declare-p errmsg

declare -a errmsg=([0]="ls: cannot access '/tnt': No such file or directory")

更进一步 然后

必须输出如下内容：

drwxrwxrwt 4 root root 4096 Jan 01 1970 /tmp

drwxrwxrwt 4 root root 4096 Jan 01 1970 /tmp

其次是：

printmsg

将显示

Err: ls: cannot access '/tnt': No such file or directory

---

exec{HOLDERR}@KamilCuk你说得对！答案已编辑！但当然，这可能会阻塞，但不适用于raisonable
STDERR
output（小于64k；）。您好。谢谢你的回复！我会研究这一点，但我承认这远远超出了我目前的理解，所以我必须努力研究它，看看我是否能够实现和工作：）我以为我只是错过了一些简单的东西，但似乎如果我真的想实现这一点，我将需要更多复杂的代码。。。我会一直向您发帖的。您希望继续像下面这样测试控制台的输出
exec 5>&1；err=$（ls sadfasf 2>&1>&5）
控制台上无任何内容，仅在varHi中。我同意@Ivan的观点，这一个不起作用。请记住，我只想从var中的RScript捕获错误流，但是在控制台上有错误和输出，您是对的
tee
是复制流所必需的。更新了我的答案这没有回答问题。@Barmar你能不能重新打开这个问题，因为有针对性的答案没有回答它
ls -ld /t{mp,nt} 2>&${HOLDERR}

drwxrwxrwt 4 root root 4096 Jan 01 1970 /tmp

printmsg

Err: ls: cannot access '/tnt': No such file or directory