Bash 不同列表中的元素匹配

通常：我有两组输入文件，它们的名称相同，但扩展名不同

使用bash，我制作了一个简单的脚本，它创建了两个具有相同元素名称的列表，同时从两个dir循环两组文件，并仅使用w/o扩展名作为这些列表的元素：

#!/bin/bash
workdir=/data2/Gleb/TEST/claire+7d4+md/water_analysis/MD1
traj_all=${workdir}/tr_all
top_all=${workdir}/top_all

#make 2 lists for both file types
Trajectories=('');
Topologies=('');

#looping of 1st input files
echo "Trr has been found in  ${traj_all}:"
for tr in ${traj_all}/*; do # ????
 tr_n_full=$(basename "${tr}")
 tr_n="${tr_n_full%.*}"
 Trajectories=("${Trajectories[@]}" "${tr_n}");
done
#sort elements within ${Trajectories[@]} lists!!  >> HERE I NEED HELP!

#looping of 2nd files
echo "Top has been found in ${top_all}:"
for top in ${top_all}/*; do # ????
 top_n_full=$(basename "${top}")
 top_n="${top_n_full%.*}"
 Topologies=("${Topologies[@]}" "${top_n}");
done
#sort elements within ${Topologies[@] lists!!  >> HERE I NEED HELP!


#make input.in file for some program- matching of elements from both lists  >> HERE I NEED HELP!
for i in $(seq 1 ${#Topologies[@]}); do
printf "parm $top_all/${Topologies[i]}.top \ntrajin $traj_all/${Trajectories[i]}.mdcrd\nwatershell ${Area} ${output}/watershell_${Topologies[i]}_${Area}.dat > output.in
done

如果有人能为我提供如何改进此脚本的良好可能性，我将不胜感激： 1我需要在每个列表中添加最后一个元素后，以类似的模式对两个列表中的元素进行排序； 2我需要在脚本的最后一步添加一些测试，这将创建最终输出。在文件中，只有在元素原则上相同的情况下，在这种情况下，它始终应该是相同的！在这两个列表中，printf在此操作期间匹配

谢谢你的帮助

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Gleb

以下是创建阵列的一种更简单的方法：

# Create an empty array
Trajectories=();

for tr in "${traj_all}"/*; do
  # Remove the string of directories
  tr_base=${tr##*/}
  # Append the name without extension to the array
  Trajectories+="${tr_base%.*}"
done

在bash中，这通常会导致一个排序列表，因为glob中*的扩展是排序的。但你可以用sort排序；如果您确定文件名中没有换行符，则最简单的方法是：

mapfile -t sorted_traj < <(printf %s\\n "${Trajectories[@]}" | sort)

如果创建两个差异列表，则如果两个列表均为空，则两个数组相等。但是，如果您希望两个阵列相同，并且这可能不是时间关键性的，则可以执行简单的预检查：

if [[ "${a[*]}" = "${b[*]}" ]]; then
  # the arrays are the same
else
  # the arrays differ; do some more work to see how.
fi

if [[ "${a[*]}" = "${b[*]}" ]]; then
  # the arrays are the same
else
  # the arrays differ; do some more work to see how.
fi