如何将.h5文件转换为.csv?

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我下载了一个以.tar.gz文件形式存在的大型数据集

解包将产生多个文件夹的数据,每个单独的数据文件都是.h5文件的形式。我需要将数据转换成.csv或.tsv格式,以便我可以轻松地将其导入到R中并在R中使用


有人能告诉我怎么做吗?

我不确定您使用的是什么操作系统,但这里有一个tar手册页

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您可以使用rhdf5(BioConductor,而不是CRAN)或h5包读取带有R的.h5文件。许多.h5文件包含稀疏矩阵,因此下游应用程序可能需要将其转换为标准矩阵形式。

您可以使用rhdf5(BioConductor,而不是CRAN)或h5包使用R读取.h5文件。许多.h5文件包含稀疏矩阵,因此下游应用程序可能需要将其转换为标准矩阵形式。

tar xzvf filename.tar.gz
解压tar文件。那部分很简单。您真正的问题似乎是如何处理h5文件。如果这是一个公共数据集,也许您可以提供一个链接,以便其他人能够更好地帮助您。
tar xzvf filename.tar.gz
解压tar文件。那部分很简单。你真正的问题似乎是如何处理h5文件。如果这是一个公共数据集,也许你可以提供一个链接,以便其他人可以更好地帮助你。