Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/9/google-cloud-platform/3.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

Notice: Undefined index: in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 180

Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181
Google cloud platform dsub:google云错误(“退出状态141”)_Google Cloud Platform_Google Genomics - Fatal编程技术网

Google cloud platform dsub:google云错误(“退出状态141”)

Google cloud platform dsub:google云错误(“退出状态141”),google-cloud-platform,google-genomics,Google Cloud Platform,Google Genomics,我试着用dsub在谷歌云上运行一些全基因组测序样本。dsub命令对某些示例正常工作,但对其他示例无效。我尝试过减少并行线程的数量,增加内存和磁盘,但仍然失败。由于每次运行大约需要2天时间,试错法非常昂贵!如有任何帮助/提示,将不胜感激 我的命令是: dsub \ --project "${MY_PROJECT}" \ --zones "us-central1-a" \ --logging "${LOGGING}" \ --vars-include-wildcards \

我试着用dsub在谷歌云上运行一些全基因组测序样本。dsub命令对某些示例正常工作,但对其他示例无效。我尝试过减少并行线程的数量,增加内存和磁盘,但仍然失败。由于每次运行大约需要2天时间,试错法非常昂贵!如有任何帮助/提示,将不胜感激

我的命令是:

dsub \    
  --project "${MY_PROJECT}" \
  --zones "us-central1-a" \
  --logging "${LOGGING}" \
  --vars-include-wildcards \
  --disk-size 800 \
  --min-ram 60 \
  --image "us.gcr.io/xxx-yyy-zzz/data" \
  --tasks "${SCRIPT_DIR}"/tBOWTIE2.tsv \
  --command 'bismark --bowtie2 --bam --parallel 2 "${GENOME_REFERENCE}" -1 "${INPUT_FORWARD}" -2 "${INPUT_REVERSE}" -o "${OUTPUT_DIR}"' \
  --wait
带有“--full”选项的dstat命令将错误显示为:

  status: FAILURE
  status-detail: "11: Docker run failed"
日志文件中的最后一行,在谷歌云上,只是声明“(退出状态141)”


非常感谢

退出状态141
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