Google cloud platform dsub:google云错误(“退出状态141”)
我试着用dsub在谷歌云上运行一些全基因组测序样本。dsub命令对某些示例正常工作,但对其他示例无效。我尝试过减少并行线程的数量,增加内存和磁盘,但仍然失败。由于每次运行大约需要2天时间,试错法非常昂贵!如有任何帮助/提示,将不胜感激 我的命令是:Google cloud platform dsub:google云错误(“退出状态141”),google-cloud-platform,google-genomics,Google Cloud Platform,Google Genomics,我试着用dsub在谷歌云上运行一些全基因组测序样本。dsub命令对某些示例正常工作,但对其他示例无效。我尝试过减少并行线程的数量,增加内存和磁盘,但仍然失败。由于每次运行大约需要2天时间,试错法非常昂贵!如有任何帮助/提示,将不胜感激 我的命令是: dsub \ --project "${MY_PROJECT}" \ --zones "us-central1-a" \ --logging "${LOGGING}" \ --vars-include-wildcards \
dsub \
--project "${MY_PROJECT}" \
--zones "us-central1-a" \
--logging "${LOGGING}" \
--vars-include-wildcards \
--disk-size 800 \
--min-ram 60 \
--image "us.gcr.io/xxx-yyy-zzz/data" \
--tasks "${SCRIPT_DIR}"/tBOWTIE2.tsv \
--command 'bismark --bowtie2 --bam --parallel 2 "${GENOME_REFERENCE}" -1 "${INPUT_FORWARD}" -2 "${INPUT_REVERSE}" -o "${OUTPUT_DIR}"' \
--wait
带有“--full”选项的dstat命令将错误显示为:
status: FAILURE
status-detail: "11: Docker run failed"
日志文件中的最后一行,在谷歌云上,只是声明“(退出状态141)”
非常感谢
退出状态141
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