如何从python中写入和读取java位集？

我正在使用化学开发工具包计算化学结构的“指纹”。我想把它们保存在一个sql数据库中，但我知道什么是存储和读取数据的最佳方式。我目前正在使用python，因为代码的其他部分在jython中不起作用

我正在使用jpype接口到包

import os
from jpype import *

_jvm=os.environ["JPYPE_JVM"]
_cp=os.environ['CLASSPATH']
startJVM(_jvm, "-Djava.class.path="+_cp)
cdk=JPackage("org").openscience.cdk

完成所有工作的示例部件如下所示：

sp = cdk.smiles.SmilesParser(cdk.DefaultChemObjectBuilder.getInstance())
mol=sp.parseSmiles('CCCCC')    
ECFP=cdk.fingerprint.CircularFingerprinter
fingerp=ECFP(ECFP.CLASS_ECFP6)
fp1 = fingerp.getBitFingerprint(mol).asBitSet()
fp1.toString()

这个输出

out: u'{61, 152, 222, 777, 825, 947, 993}'

请注意，fp1是一个位集

编辑：我无法再次将输出字符串读入位集中

我试过的

fps=fp1.toString()    
bit=java.util.BitSet.valueOf({fps})

这是回报

RuntimeError: No matching overloads found. at src/native/common/jp_method.cpp:121

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“高效”是什么意思？它看起来不大，所以你希望它在哪些方面“高效”？@pvg这只是一个例子。这可能需要对超过一百万个不同的文件执行。因此，读/写操作需要尽可能快。只有当您知道它在整个运行时中占了很大一部分时，才需要尽可能快。所以，最明智的做法是，天真地实施它，测量它，如果有问题，回来问一个具体的问题。实际上，这太模糊了，无法回答，任何答案都是猜测。@pvg我一直坚持的部分是将输出字符串读回位集中。我编辑了这个问题来反映这一点。您需要查看这些类的Javadoc

BitSet

没有采用字符串的

valueOf

方法。您可以使用

toLongArray

和

valueOf

，例如，其他选项也应该从文档中清除。