Java org.obolibrary.oboformat.parser.OBOFormatParser警告：行：901位置处应为空白行：</rdf:rdf>；

我正在使用一个java项目从一个文件（

dbpedia_2016-10.owl

）加载一个本体，向这个本体添加一些公理，然后作为一个新的本体写入

.owl

文件。后来在我的项目中，我使用

loadOntologyFromOntologyDocument（新文件（“DBpedia_modified.owl”）

从

OWLOntology

加载了新的本体，我收到了多行警告：我注意到解析器在

pos 5

或

pos 6

，这与字符

：

相关：

Jan 04, 2020 12:57:49 PM org.obolibrary.oboformat.parser.OBOFormatParser warn
WARNING: LINE: 84  Expected white space at pos: 5  LINE:
<owl:someValuesFrom rdf:resource="http://dbpedia.org/ontology/MusicGenre"/>
Jan 04, 2020 12:57:49 PM org.obolibrary.oboformat.parser.OBOFormatParser warn
WARNING: LINE: 85  Expected white space at pos: 6  LINE:
</owl:Restriction>

2020年1月4日12:57:49 PM org.obolibrary.oboformat.parser.OBOFormatParser警告
警告：行：84位置5处的预期空白行：
2020年1月4日12:57:49 PM org.oboboblibrary.oboformat.parser.OBOFormatParser警告
警告：行：85位置处的预期空白：6行：

由于我对这一领域相当陌生，我不理解为什么解析器希望使用空格而不是

：

；我的问题是警告有多严重？我怎样才能修好它？我在谷歌上搜索了一下，但没有找到正确的答案

---

提前感谢您的指导。

您可以忽略此警告。您的文件是RDF格式的，警告来自OBO解析器

如果不指定本体使用的格式，OWLAPI将尝试所有可用的解析器，直到找到一个接受本体的解析器。OBO解析器拒绝（正确地）解析本体，并且还发出警告，这超出了它应该做的，因为此时它应该已经抛出异常

编辑：为避免使用OBO解析器，您可以选择应使用的格式：

manager.loadOntologyFromOntologyDocument(
        new FileDocumentSource(file, new RDFXMLDocumentFormat()));

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这将只尝试一个解析器（我猜您的文件格式是RDF/XML）。

有没有办法“隐藏”这个警告？它是通过slf4j记录的，这样您就可以配置日志系统，只为obo包输出错误。我不认为我使用sel4j进行日志记录，至少不直接使用；我hma在哪里配置日志系统有点问题（我正在使用Eclipse），我非常感谢您的指导！OWLAPI使用slf4j，并且，鉴于您看到的是日志记录，在您的类路径中必须有一个slf4j实现。我不知道到底是哪一个，而且配置也各不相同。如果您检查您的类路径，您将发现slf4j api和至少一个名称中包含slf4j的jar。知道那个jar的名称会告诉我们它接受什么配置。是的，我可以在我的Maven依赖中看到有

self4j-api-1.7.10.jar

和

jcl-over-sel4j-1.7.7.jar

。对于您答案中的编辑，我得到的

构造函数FileDocumentSource（File，RDFXMLDocumentFormat）是未定义的

。构造函数似乎只接受一个参数，即

File

type。