for，do，done在linux中将txt转换为biom格式

我有一个包含大量

txt

文件的文件夹，我想应用

for do

循环将它们从

txt

转换为

biom

文件，我做了以下工作：

for txt in folder/*.txt
do biom convert -i $txt -o *.biom --to-hdf5
done

但我有一份生物组合档案

如何修改上述代码，将多个txt文件更改为biom文件，而不更改原始文件名

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例如：

test.txt

到

test.biom

下面应该可以实现这一点（假设文件名中现在有空格）：

bash替换

${txt%.txt}

去除变量的

.txt

，并在最后添加

.biom

for txt in folder/*.txt
do biom convert -i $txt -o  ${txt%.txt}.biom --to-hdf5
done