在macOS上的python 2.7上安装rpy2

我在macOS High Sierra上有python版本2.7.10，希望安装rpy2

当我做sudopip安装rpy2时

我收到错误消息：

Command "python setup.py egg_info" failed with error code 1 in /private/tmp/pip-build-Nwbha3/rpy2/

clang: error: unsupported option '-fopenmp'
clang: error: unsupported option '-fopenmp'
error: command 'cc' failed with exit status 1
----------------------------------------
Command "/usr/bin/python -u -c "import setuptools, tokenize;__file__='/private/tmp/pip-O0cu4E-build/setup.py';f=getattr(tokenize, 'open', open)(__file__);code=f.read().replace('\r\n', '\n');f.close();exec(compile(code, __file__, 'exec'))" install --record /tmp/pip-haDUA3-record/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile" failed with error code 1 in /private/tmp/pip-O0cu4E-build/

我已经升级了setuptools（版本39.0.1）

我还下载了旧版本rpy2-2.7.0.tar.gz，并尝试使用sudo pip install rpy2-2.7.0.tar.gz安装它。然后，我收到以下错误消息：

Command "python setup.py egg_info" failed with error code 1 in /private/tmp/pip-build-Nwbha3/rpy2/

clang: error: unsupported option '-fopenmp'
clang: error: unsupported option '-fopenmp'
error: command 'cc' failed with exit status 1
----------------------------------------
Command "/usr/bin/python -u -c "import setuptools, tokenize;__file__='/private/tmp/pip-O0cu4E-build/setup.py';f=getattr(tokenize, 'open', open)(__file__);code=f.read().replace('\r\n', '\n');f.close();exec(compile(code, __file__, 'exec'))" install --record /tmp/pip-haDUA3-record/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile" failed with error code 1 in /private/tmp/pip-O0cu4E-build/

如果有人能解答我的安装问题，我将不胜感激。

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非常感谢

Mac附带的

clang

不支持

openmp

，这正是

-fopenmp

标志的作用。您可能需要一个支持openmp的clang版本

一个可能的解决方案是使用openmp支持获得完整的llvm/clang构建。使用自制软件，您可以：

brew install llvm    # clang/llvm
brew install libomp  # OpenMP support

然后用新安装的clang版本再次尝试安装

rpy2

例如，当前版本是

6.0.0

，因此您可以运行

CC=/usr/local/Cellar/llvm/6.0.0/bin/clang pip install rpy2

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您使用的是哪一版本的pip？Mac附带的

clang

不支持

openmp

，这正是

-fopenmp

标志的作用所在。我的pip版本是9.0.3。很快，二进制软件包将可用，以便安装再次开箱即用。以下是相关问题：请注意，此过程链接到由Homebrew安装的

libomp

。如果您想链接到官方R框架附带的lib，请参阅BItBucket问题。