MPI：报告绑定

我正在使用

-rankfile

和

-hostfile

标志运行具有特定绑定的MPI程序。如何检查是否进行了正确的绑定（只是为了确保）？我尝试了

--报告绑定

标志。比如：

mpirun --report-bindings -rankfile rank_file -hostfile host_file -n 16 ./$prog

---

但是，它没有提供任何输出。我使用的是OpenMPI版本1.5.4。我做错了什么？

可能是您的标准错误，

odls

框架打印绑定信息的地方被重定向到了某个地方。它适用于我的Open MPI 1.5.3：

$ mpiexec --report-bindings -rankfile rank_file -hostfile host_file \
          -n 4 hostname
host
[host:18314] [[35226,0],0] odls:default:fork binding child [[35226,1],0] to slot_list 0
[host:18314] [[35226,0],0] odls:default:fork binding child [[35226,1],1] to slot_list 1
[host:18314] [[35226,0],0] odls:default:fork binding child [[35226,1],2] to slot_list 0
[host:18314] [[35226,0],0] odls:default:fork binding child [[35226,1],3] to slot_list 1
host
host
host

如果库由于任何原因未能报告绑定，您可以使用简单的脚本检查绑定是否实际发生：

#/垃圾箱/垃圾箱
cpuset=$（cat/proc/self/status | grepcpus |允许的| awk'{print$2；}'）
echo“级别$OMPI\u COMM\u WORLD\u绑定到核心的级别$cpuset”

只需将其命名为

report\u bindings

，并通过

mpiexec

运行即可：

$ mpiexec --report-bindings -rankfile rank_file -hostfile host_file \
          -n 4 report_bindings
Rank 1 bound to core(s) 8
Rank 0 bound to core(s) 0
Rank 3 bound to core(s) 8
Rank 2 bound to core(s) 0

---

可能是您的标准错误，

odls

框架正在打印绑定信息，正在重定向到某个地方。它适用于我的Open MPI 1.5.3：

$ mpiexec --report-bindings -rankfile rank_file -hostfile host_file \
          -n 4 hostname
host
[host:18314] [[35226,0],0] odls:default:fork binding child [[35226,1],0] to slot_list 0
[host:18314] [[35226,0],0] odls:default:fork binding child [[35226,1],1] to slot_list 1
[host:18314] [[35226,0],0] odls:default:fork binding child [[35226,1],2] to slot_list 0
[host:18314] [[35226,0],0] odls:default:fork binding child [[35226,1],3] to slot_list 1
host
host
host

如果库由于任何原因未能报告绑定，您可以使用简单的脚本检查绑定是否实际发生：

#/垃圾箱/垃圾箱
cpuset=$（cat/proc/self/status | grepcpus |允许的| awk'{print$2；}'）
echo“级别$OMPI\u COMM\u WORLD\u绑定到核心的级别$cpuset”

只需将其命名为

report\u bindings

，并通过

mpiexec

运行即可：

$ mpiexec --report-bindings -rankfile rank_file -hostfile host_file \
          -n 4 report_bindings
Rank 1 bound to core(s) 8
Rank 0 bound to core(s) 0
Rank 3 bound to core(s) 8
Rank 2 bound to core(s) 0

---

太好了，行得通。我不知道为什么--报表绑定标志没有提供信息。也许我有点不对劲。我倾向于在程序输出上有这样的问题。有时它只是开始不给我任何关于输出的信息，但是如果我在代码中添加另一条cout指令，一切都会正常工作。我应该补充一点，这不是因为刷新，因为函数被相应地调用了。老实说，我不知道。通常，OpenMPI的I/O重定向是非常健壮的。非常好。我不知道为什么--报表绑定标志没有提供信息。也许我有点不对劲。我倾向于在程序输出上有这样的问题。有时它只是开始不给我任何关于输出的信息，但是如果我在代码中添加另一条cout指令，一切都会正常工作。我应该补充一点，这不是因为刷新，因为函数被相应地调用了。老实说，我不知道。通常，OpenMPI的I/O重定向非常健壮。