Oop 如何在Matlab中使用聚类图的其他聚类方法'；生物信息学工具箱

编辑：我想出来了。只是不懂符号

你好,

希望有人熟悉生物信息学工具箱中的聚类图。我对函数的图形方面（树状图/热图）很感兴趣，但由于需要使用Matlab的cluster（）函数，我目前有一些障碍。我更愿意使用我的个人算法进行聚类，然后让Matlab为我可视化

我已经搜索了代码，但遗憾的是，我对一般的面向对象编程一无所知，尤其是对Matlab的版本。因此，我所知道的只是函数调用行“obj=obj.getclusters”，但不知道如何编辑它，因此我使用自己的聚类算法而不是Matlab的

感谢您的帮助

编辑：我正在专门研究一种新算法，因此我不需要pdist或链接。树状图是在聚类图函数之外计算的。我用来创建树状图/热图的只是clustergram函数。我的生物信息学工具箱是3.3版

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真的，我在这里寻找的是'obj=obj.getclusters；'做我不是程序员，也不太熟悉OO。对我来说，这看起来就像我们神奇地拥有集群，因为没有函数调用。这是clustergram（）的第304行。首先，我有更高版本的生物信息学工具箱（3.4和更高版本），对于那些版本的clustergram.m文件没有行

obj=obj.getclusters

请记住在类中（不是旧版本的函数）。当您运行
clustergram（data，…）
时，您实际上运行这个类的构造函数方法来创建clustergram对象。此对象是
obj
变量。因此，当您运行
obj=obj.getclusters
您实际上在clustergram类中运行
getclusters
方法，该方法更新对象
obj

要获取更多详细信息，请在“方法”块中查找以下行：

    function obj = getcluster(obj)


在最新版本中，有一种方法
computeClusters
定义为

    function computeClusters(obj)

此方法计算行和列的树状图并更新对象。当然，您可以直接更改此函数，但我不推荐这样做。最好为距离度量和链接开发单独的函数，并使用这些函数构造聚类图对象

如果您的算法不使用距离和链接，请解释如何构建树状图。它是否创建与函数输出相同的链接矩阵？没有这样的矩阵，我不认为你可以使用聚类图，即使只是为了可视化。你有没有举例说明你的聚类图应该是什么样子的？可能您可以使用其他更简单的函数类，如或。
您希望使用哪种数据进行可视化？你计算聚类图之外的树状图吗？Pdist和悬挂机构参数不够？你的MATLAB版本是什么，生物信息学工具箱？我同意@yuk，我们需要更多细节。如果您发布一个简单的工作示例，其中包含您当前用于生成树状图/热图的函数，也会有所帮助。。。