php中的exec（）函数出错

我在php中从命令行运行程序时遇到一些问题。每当我在命令行中运行程序时，都会创建正确的文件，并且它工作得非常好。但是，当我把它放在php中并使用exec（）函数时，什么都没有发生

最后，我希望用户能够选择他想要在外部程序上运行的参数，但现在我只是尝试在…中使用硬编码的值来运行它

下面是我用来从命令行运行程序的命令及其参数

 [path1] -p blastp -d [parameter1] -i [path2] -e [parameter2] -m 9 -o [path3]

 where [path1] is the path to ../blast-2.2.26/bin/blastall, 
       [path2] is the path to sample.fasta
       [path3] is the path for the output file (you may want to create another folder for generating the output)
       [parameter1] is the name of database chosen by the user from your page (eg. Human.db, Viruses.db, etc)
       [parameter2] is the E-value given by the user from your page(eg. 0.0001, 1, 1000, etc)

我将在命令行中键入的实际代码是

~/blast/blast-2.2.26/bin/blastall -p blastp -d db -i ~/temp/sample.fasta -m 9 -o output'

这是到目前为止我的代码

<form method="POST", action="/~cs4380sp15grp4/home/blast.php">


<?php
    session_start();
    require_once '../secure/database.php';
    $mysqli = new mysqli($dbhost,$dbuser,$dbpass,$dbname);

    if($mysqli->connect_error){
            exit('CON Error: ' . $mysqli->connect_errno . ' ' . $mysqli->connect_error);
    }

    //Insert the values into the database

    if(isset($_POST['submit'])){


            $db = $_POST['database'];
            $evalue = $_POST['evalue'];
            $sequence = $_POST['BlastSearch'];



             exec('/students/groups/cs4380sp15grp4/blast/blast-2.2.26/bin/blastall -p blastp -d db -i /students/groups/cs4380sp15grp4/temp/sample.fasta -m 9 -o /students/groups/cs4380sp15grp4/temp/output');
    }





?>

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因此，我的exec函数在我的php页面中不起作用，因为相同的命令在终端中起作用。

Apache服务器用户有权访问该程序吗？为确保安全，请尝试运行sudo chmod 755/students/groups/cs4380sp15grp4/blast/blast-2.2.26/bin/blastall，然后重试

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同样，确保Apache进程可以访问输入和输出目录。

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