Python 3.x 尝试在受保护服务器上的venv中运行snakemake时出错

对于一个项目，我使用Python3创建了一个虚拟环境（venv）。激活venv后，我使用一个简单的bash脚本（见下图）安装了所有必要的依赖项。（我使用：

pip3 list

验证了已安装的软件包，并得出结论，每个依赖项都已成功安装。）

我的项目使用snakemake，所以我运行了这个snakemake突击队：

snakemake --snakefile Snakefile.py all

我得到这个错误：

我知道这与venv有关，因为没有venv，蛇怪运行得很完美。我已经阅读了Snakemake安装文件，上面说我必须安装conda并制作并激活conda venv。但是，我没有sudo特权下载和安装conda（我在受保护的服务器上工作）

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发生了什么，有人知道修复方法吗？

一个可能的原因可能是Python版本的不同。

pip3

环境为哪一版本的Python做准备

从提供的图片中可以看出，无效语法可能是因为Python版本不支持f字符串

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设想以下两种情况：当您手动运行Snakemake时，您使用最新的Python3（例如3.9）。但是，如果为旧版本（例如3.5）配置了

pip3

，则可以为不支持f字符串的Python3.5配置完全不同的环境。

一个可能的原因可能是Python版本的差异。

pip3

环境为哪一版本的Python做准备

从提供的图片中可以看出，无效语法可能是因为Python版本不支持f字符串

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设想以下两种情况：当您手动运行Snakemake时，您使用最新的Python3（例如3.9）。但是如果为旧版本（例如3.5）配置了

pip3

，则可以为不支持f字符串的Python3.5配置完全不同的环境。

请包含与错误相关的代码。我可以在您的图像中看到一个

语法错误

；但是，我看不到哪个文件，因为图像被裁剪。@Salma整个错误已经显示在图片中。最后一行是命令行。打印作业id属性时是否尝试使用单引号而不是双引号？这行似乎有语法错误。解决方案：我的python版本与snakemake的最新版本不兼容。最新的snakemake版本使用f字符串文字。我使用的是python 3.5.3，它没有f-string文本。：）很高兴您发现了它，请包含与错误相关的代码。我可以在您的图像中看到一个

语法错误

；但是，我看不到哪个文件，因为图像被裁剪。@Salma整个错误已经显示在图片中。最后一行是命令行。打印作业id属性时是否尝试使用单引号而不是双引号？这行似乎有语法错误。解决方案：我的python版本与snakemake的最新版本不兼容。最新的snakemake版本使用f字符串文字。我使用的是python 3.5.3，它没有f-string文本。：）很高兴你找到了它