Python 3.x Gitlab CI/CD:使用Conda运行的Pytest

上下文：我正在尝试设置一个gitlab CI/CD，在推送代码时测试我的构建并运行pytest测试

问题：当我推送我的代码时，CI/CD作业失败，说明：

/bin/bash: line 55: pytest: command not found
ERROR: Job failed: exit code 1

问题：如何消除错误，如何正确设置gitlab CI/CD？

详细信息：我（部分）遵循了，并创建了一个

.gitlab ci.yml

文件，如下所示：

image: continuumio/miniconda3:latest

testbuild :
  stage: build
  script:
    - conda create --name test_env --file requirements.txt
    - source activate test_env
    - python setup.py install

tests:
  stage: test
  script:
    - cd tests && pytest .

我的项目架构：

$ tree -L 1
project
├── package1/
├── package2/
├── data/
├── out/
├── __pycache__
├── requirements.txt
├── setup.py
└── tests/

我的

requirements.txt

（为了方便读者，从许多无用的东西中剥离出来），它是用命令

conda list-e

创建的：

# This file may be used to create an environment using:
# $ conda create --name <env> --file <this file>
# platform: linux-64
scikit-learn=0.20.0=py36h4989274_1
scipy=1.1.0=py36hfa4b5c9_1
# ...
setuptools=40.4.3=py36_0
pip=10.0.1=py36_0
py=1.7.0=py36_0
pytest=3.9.1=py36_0
python=3.6.6=h6e4f718_2
wheel=0.32.1=py36_0

#此文件可用于创建环境，使用：
#$conda create--name--file
#平台：linux-64
scikit学习=0.20.0=py36h4989274_1
scipy=1.1.0=py36hfa4b5c9_1
# ...
setuptools=40.4.3=py36_0
pip=10.0.1=py36_0
py=1.7.0=py36_0
pytest=3.9.1=py36_0
python=3.6.6=h6e4f718_2
车轮=0.32.1=py36_0

我已将我的

.gitlab ci.yml

更改为：

image: continuumio/miniconda3:latest

testbuild :
  stage: build
  script:
    - conda create --name test_env --file requirements.txt
    - source activate test_env
    - python setup.py install
    - cd tests && pytest .

在同一部分中重新组合

测试

和

测试构建

。它现在可以工作了，它安装了所有的东西并运行测试，尽管这样做感觉很糟糕，因为我不再做分离了

---

正如hoefling在评论中所说的，问题在于gitlab没有在阶段之间保护环境。如果你真的想把这两者分开，看看这个：

requirements.txt的内容是什么？哦，是的，我知道我忘了什么，对不起。它已被编辑。我没有列出整个列表，因为它感觉有很多内容，但我试着列出重要的依赖项（首先是pytest）。可能conda env激活在两个阶段之间未设置，尝试在测试阶段重新激活它：

cd-tests&&source-activate-test\u-env&&pytest。

我按照您编写的那样做，得到了一些不同的东西：

$cd-tests&&source-activate-test\u-env&&pytest。找不到conda环境：test_env您可以使用conda info--envs列出所有可发现的环境。

看起来gitlab没有在阶段之间保留环境。看看。我同意这个解决方案（因为我自己花了很多时间来解决这个问题！）。您也可以使用condaenvcreate-f，但我觉得condacreate目前更加灵活。实际上，您可以使用“conda create”与“conda env create”进行脱机操作（假设您的基本conda repo中有所需的包）。