在cmd中通过Python运行工具不等待

我正在通过

cmd

中的

Python

运行一个工具。对于给定目录中的每个示例，我希望该工具能够有所作为。但是，当我在循环中使用

process=subprocess.Popen（command）

时，命令不会一直等到完成，一次会产生10个提示。当我使用

subprocess.Popen（command，stdout=subprocess.PIPE）

时，命令仍然是黑色的，我看不到进度，尽管它会一直等到命令完成

是否有人知道如何通过

cmd

中的

Python

调用外部工具，该工具会一直等到命令完成，并且能够在

cmd

中显示工具的进度

#main.py
        for sample in os.listdir(os.getcwd()):
            if ".fastq" in sample and '_R1_' in sample and "Temp" not in sample:
                print time.strftime("%H:%M:%S")
                DNA_Bowtie2.DNA_Bowtie2(os.getcwd()+'\\'+sample+'\\'+sample)

#DNA_Bowtie2.py
            # Run Bowtie2 command and wait for process to be finished.
            process = subprocess.Popen(command, stdout=subprocess.PIPE)
            process.wait()
            process.stdout.read()

---

Edit:command=一个perl或java命令。在上面的构造中，我看不到工具输出，因为提示符（perl窗口或java窗口）仍然是黑色的。

这里的顺序很重要：首先读取输出，然后等待

如果您这样做：

process.wait()
process.stdout.read()

如果管道缓冲区已满，您可能会遇到死锁：子进程在等待标准输出时阻塞，永远不会到达末尾；程序在

wait（）

时阻塞，永远不会到达

read（）

取而代之

process.stdout.read()
process.wait()

它将一直读到EOF

如果您想要进程的stdout，则此选项适用

如果您不想这样做，那么应该省略

stdout=PIPE

内容。然后将输出定向到该提示窗口。然后还可以省略

process.stdout.read（）

---

通常，

process.wait（）

会阻止10个实例同时运行。如果这不起作用，我不知道为什么不…

看起来您的子流程会分叉，否则等待（）将无法在流程完成之前返回。

process.communicate（）

应该等待流程完成。这导致至少10个流程（目录中还有10个示例）。而不是1乘1。所以这不起作用。process=subprocess.Popen（command）process.communicate（），所以您希望它被阻塞，那么wait（）应该是解决方法。不知道为什么它对你不起作用。您是否尝试过使用

subprocess.call（command）

我可以阻止进程，直到它们完成。（process.wait（））。但是在当前的配置下，我看不到工具输出，我看到的只是一个黑屏。当我仅仅应用（subprocess.Popen（command））时，我看到了输出，但是process.wait（）仍然不起作用。这是有效的，唯一的一点是，当应用process=subprocess.Popen（command，stdout=subprocess.PIPE）时，Java提示符显示不显示process。提示将保持黑色，并在流程完成时关闭。我仍然看不到输出。@user3589561我扩展了我的答案。我可以阻止进程，直到它们完成。（process.wait（））。但是在当前的配置下，我看不到工具输出，我看到的只是一个黑屏。当我只是应用（subprocess.Popen（command））时，我看到了输出，但是process.wait（）仍然不起作用。我似乎不明白您的问题。I read（）/wait（）的任何顺序都不会有并发。只是wait（）/read（）不起作用。当然，除了在程序中运行并发之外。