Python pd.read_hdf抛出'；无法将此数组的可写标志设置为True'；

跑步时

pd.read\u hdf（'myfile.h5'）

我得到以下回溯错误：

[…一些更长的回溯]]

中的~/.local/lib/python3.6/site-packages/pandas/io/pytables.py 读取阵列（自身、键、启动、停止）2487 2488如果 iInstance（节点、表、VLArray）： ->2489 ret=node[0][start:stop]2490 else:2491 dtype=getattr（attrs，“value\u type”，无）

中的~/.local/lib/python3.6/site-packages/tables/vlarray.py getitem（self，key）

读取中的~/.local/lib/python3.6/site-packages/tables/vlarray.py（self， 开始、停止、步骤）

tables.hdf5extension.VLArray.\u read\u array（）中的tables/hdf5extension.pyx

ValueError:无法将此数组的可写标志设置为True

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不知道发生了什么事。我已经尝试重新安装了

表

，

熊猫

基本上什么都可以，但我不想读它。

您使用的是numpy 1.16吗？它与pytables的最新版本不兼容（请参阅），但pytables团队尚未发布固定版本：

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我发现解决这个问题的唯一方法是降级numpy

似乎是

时间-日期

字符串导致了问题，当我将这些字符串从文本转换为numpy

（pd.to_datetime（））

并存储表时，问题消失了，所以可能与文本数据有关？

将PyTables升级到版本>3.5.1应该可以解决这个问题

pip install --upgrade tables

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你能用HDFView打开

myfile.h5

并查看数据吗？或者，您是否尝试过使用

h5dump

工具读取文件？它是来自HDF组的命令行实用程序。这是另一种看你拥有什么的方式。您还可以尝试使用

pytables

命令行工具

ptdump

。这些可能有助于查明问题。当我用

h5py

打开它时，我得到了钥匙['pd']。这有4个键：

ptdump
将组结构和数据集格式转储到命令窗口（或重定向到文本文件）。如果没有错误，这是一个好的开始。您是否看到一些
Vlarray
中列出的数据
h5py
是访问HDF5数据的不同方法。它使用类似于字典的方法，其中键是顶级节点名，值是对象（组或数据集）。这样做的目的是验证有效的
HDF5
文件，以便您可以专注于自己的代码。对于我来说，numpy
1.15
和python 3.6仍然存在这个问题。python 3.5或3.7解决了这个问题。我使用的是蟒蛇环境。使用
conda forge
频道。此错误在numpy 1.15中消失。但是新的错误出现在“没有名为”numpy.core._multiarray_umath“@YueDeng”的模块上。这可能是因为hdf文件是用numpy 1.16保存的。在这种情况下，即使您降级，它也不起作用。尝试降级numpy并使用1.15再次保存hdf文件。然后它就可以工作了。我正在使用
python3.6
并将
pytables
升级到
3.5.1
，以使事情正常工作；不必重新编写HDF文件如果您在google colab上运行，请不要忘记重新启动运行时