Python 交换文件中的列位置

我有一个类似以下内容的文件：

#name   cdsStart    cdsEnd  exonCount   exonStarts  exonEnds
NM_017436   431    586    3   420,440,513,    435,500,596,
NM_001173466    720    950    4    700,752,821,823,    721,760,900,973,

我想做的是将第2列和第3列中的数字分别替换为第5列中的第一个数字和第6列中的最后一个数字。这是我想要的输出：

NM_017436   431    586    3   *431*,440,513,    435,500,*586*,
NM_001173466    720    950    4    *720*,752,821,823,    721,760,900,*950*,

为了清楚起见，我在输出文件中用星号标出了更改。我想做的是用以下脚本拆分文件：

with open('nonsensepositions.txt') as inf:
    with open('nonsensepositions_split.txt', 'w') as outf:
        for line in inf:
            outf.write('\t'.join(line.split(',')))

---

然后尝试交换特定的列，但我认为这可能是一个挑战，因为拆分后的列数量不同。然后，我必须找到一种方法，在执行交换后使其显示为原始文件。有没有更简单的方法来执行这种类型的交换，或者我需要根据

，

分割文件并按照我的建议执行？

我喜欢awk。现在我只需要知道如何使用sub。谢谢。

sub（/old/，“new”，target）

将变量

target

中的regexp

old

替换为字符串

new

。要学习awk，请获取Arnold Robbins的《有效的awk编程》，第四版。谢谢。我得研究一下如何得到那本书。

$ awk '{ sub(/^[0-9]+/,$2,$5); sub(/[0-9]+,$/,$3",",$6) } 1' file
#name   cdsStart    cdsEnd  exonCount   exonStarts  exonEnds
NM_017436 431 586 3 431,440,513, 435,500,586,
NM_001173466 720 950 4 720,752,821,823, 721,760,900,950,