Python-3D医学图像配准库

Python中有哪些库能够读取扩展名为

.vtk

或

.stl

的CT模型文件，并对普通视频执行3D图像注册。我发现很多软件都有这种能力，但我要找的不是一个程序，而是一个Python库，比如Numpy或OpenCV，我需要做的就是

import Numpy

或

import cv2

编造了我想做的事情的例子

• 步骤1-获取一个人头骨的3D CT模型
• 步骤2-将3D CT模型读入Python
• 第3步-获取一个人静止不动的正常视频
• 步骤4-执行3D CT头骨和颅骨的配准 正常视频中的人头
• 步骤5-显示注册输出

我发现了两个Python库，它们“似乎”可以做这类事情，但它们在库描述中没有足够的信息来确保这就是我想要的。我也愿意使用多个库。有没有人做过类似的事情，如果有图书馆经验的人能给我一些建议，那就太好了，谢谢。如果没有，我也会考虑其他语言的图书馆。

到目前为止我所考虑的

FW4SPL图书馆，C语言++

C语言中的MITK库++

Python中的MeVisLab软件

C语言中的Elastix库++

Python中的SimpleLastix库

ITK图书馆在C++

Python中的SimpleTk库

对于

FW4SPL

和

MITK

，由于调试旧错误后不断出现新错误，我无法成功编译源代码。似乎新错误的发生不会停止（我已经花了很多时间做这件事，不想再继续了）

对于

MeVisLab

，这不是一个Python库，如

numpy

或

opencv

，而是一个GUI，也可以说是可编程的

---

<> > <代码> Elastix <代码> >代码> SimpleElastix <代码> >代码> ITK< /COD>和<代码> SimpleITK < /C>，它们确实是C++和Python库，看起来很完美，但我不确定它们是否提供了上述应用程序的要求。另外，我对彼此之间的关系感到非常困惑。

我第一次玩vtk和stl文件。你的问题让我好奇，但我显然没有经验。在发表上述评论之前，我开始对此进行调查。对不起，我不知道我们离题了。所以我现在给你们我的结论，因为这里是为分享而建的

1） 对于.vtk文件 事实证明，我看到的大多数库都是针对Python2.7的，而我更喜欢最新版本（目前为3.5）。 对于3.5版，我最终采用了“woodscn”版本，这似乎很有希望，因为在编码方面，我觉得所有需要的信息都在上面

2） 对于.stl文件 “conda forge”的“nestly”包看起来不错，上面有一个典型的例子

然后您只需在python脚本中编写

import vtk

和

import nestly

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希望这有助于

评论拒绝投票的原因“要求我们推荐或查找书籍、工具、软件库、教程或其他非网站资源的问题与堆栈溢出无关，因为它们往往会吸引固执己见的答案和垃圾邮件。相反，请描述问题以及迄今为止为解决问题所做的工作。”@Tapio抱歉，我没有意识到这一点，因为我看到很多问题都在问类似的问题，这些问题都很受欢迎。我将编辑上面的问题以

描述问题以及迄今为止为解决问题所做的工作。

。您以前使用过吗？这是一个GUI，但它也允许您编写python脚本，而且功能非常强大——您将CT注册到人的头部是什么意思？注册时不需要基准点吗。我个人使用过Elastix，它非常适合您使用