使用一个字典的值作为另一个字典中的键，使用键的频率作为值，Python 3.6

我有字典：

CodonDict={'ATT'：'I'，'ATC'：'I'，'ATA'：'I'，'CTT'：'L'，'CTC'：'L'，…}

字典继续为64个其他独特的三元组编写

我正在遍历一个文本文件，它本质上是一个巨大的字符串。我的代码现在用64个条目更新空字典，这些条目的键从0到63：

TripletCount={0:18626，1:9187，2:9273，3:9154，4:37129，5:36764，6:18468，}

，值为三元组的频率（但键为整数）

TripletCount={}

我想使用

CodonDict

的值作为

TripletCount

中的键，键的频率作为

TripletCount

中的值

我以前用python编程过，但格式化字典从来都不是我的强项

我正在迭代的数据文件基本上如下所示：

'gtggcttcttctccatcctttttctttcctccaaacaagagaggttattattatttccaga…'

编辑：

我想得到的一个例子

TripletCount={'I'：18626，'V'：9187，'L'：9273，'Y'：9154，'E'：37129，}

编辑2：

---

根据请求：我计划通过将计数添加到列表中来解决密钥冲突，因为不同类型的碱基对可以识别相同的氨基酸，因此，

{'I'：[1862691879154]，…}

您可以遍历数据，一次查看三个连续字符，并检查三个字符的每个字符串是否是

CodonDict

字典中的一个键。如果是，您可以增加

TripletCount

的值

例如，使用问题中的示例数据集：

CodonDict = {'ATT':'I',   'ATC':'I',  'ATA':'I',  'CTT':'L',  'CTC':'L'}
TripletCount = {}
data = 'GTGGCTTCTCTTCTCCACTCCTCTTTTTATTCCTTCCCAAACAAGAAGGTTAGTTATTATTATTTCCAGA'

for i in range(3, len(data)): # iterates through your data string 
    triplet = CodonDict.get(data[i-3:i]) # check if the next 3 characters in a row are a key in CodonDict
    if triplet: # if it is a key: increment the count of its value by one
        TripletCount[triplet] = TripletCount.get(triplet, 0) + 1

print(TripletCount)
{'I': 4, 'L': 8}

---

键在字典中是唯一的，因此在

TripletCount

中，每个值都将等于

1

如果我误解了你的问题，请纠正我

以下代码可以通过使用defaultdict的defaultdict解决您的问题

from collections import defaultdict as ddict


CodonDict = {'ATT':'I',   'ATC':'I',  'ATA':'I',  'CTT':'L',  'CTC':'L'}
TripletCount = ddict(lambda:ddict(int))


for key,value in CodonDict.items():
    TripletCount[value][key] += 1

---

TrpletCount

中的值是defaultdict，您可以通过类似于

map

的方式将它们转换为列表，您可以添加一个您想要的结果示例吗？当然可以：

TripletCount={'I'：18626，'V'：9187，'L'：9273，'Y'：9154，}

至于我，现在很难转换您的dict。相反，您可以尝试在解析DNA字符串期间插入密码子作为键。您还可以添加生成

TripletCount

dict的代码吗？您的

CodonDict

示例值不是唯一的，因此，当这些值成为键时，您计划如何解决键冲突？@Oleksander这就是我想知道的方法，有没有办法将这些值作为键“附加”到另一个dict中？当另一个dict确保碱基对（如AAT等）仍然在另一个dict中指定键的频率时，如果这有意义的话？哇，谢谢你，这否定了我花在这两天的时间，它起作用了！！再次感谢！你也可以使用据说比常规字典+1方法快得多的方法来计算东西。@Arjoon你可以使用

计数器

，但我不确定在这种情况下这能给你带来多少，因为你仍然需要迭代

数据

字符串。您可以对范围（3，len（data））中的i执行类似于

计数器（CodonDict.get（data[i-3:i]）的操作

，然后删除/忽略

None

键。