Python 如何使用rpy2访问R包的内部函数？

我正在使用rpy2在Python中使用R的

GMCM

包。GMCM包的一些内部函数只能使用

：：

操作符访问。例如，

qgmm.marginal

不能以常规方式使用rpy2访问

以下是我的Python代码：

import rpy2

import rpy2.robjects as robjects
from rpy2.robjects.packages import importr  
gmcm_r = importr('GMCM')
data_r = gmcm_r.SimulateGMCMData(n = 100, m =3, d=2)

print(gmcm_r.Uhat(data_r.rx2('z'))) # works
print(gmcm_r.qgmm.marginal(gmcm_r.Uhat(data_r.rx2('z')))) # does not work
# AttributeError: module 'GMCM' has no attribute 'qgmm'

相应的R代码为

library(GMCM)
data = SimulateGMCMData(n = 100, m =3, d=2)
u = Uhat(data$z) #works
GMCM:::qgmm.marginal(u, theta)#works

如何使用rpy2访问这些内部函数？

您有两个错误：

您保留了一个R语法点（

），您应该将其转换为python语法下划线（

。

）。这就是你观察到的错误的原因

但是，一旦修复了该错误，您就会发现一个新错误：您没有为尝试调用的函数指定

theta

参数

这里有一个可行的解决方案：

导入rpy2
将rpy2.robjects作为robjects导入
从rpy2.robjects.packages导入导入
gmcm_r=importr（'gmcm'）
数据=gmcm模拟数据（n=100，m=3，d=2）
印刷（gmcm_r.Uhat（数据_r.rx2（'z'）））#作品
##[输出省略]
u=gmcm_r.Uhat（数据_r.rx2（'z'））
θ=数据。rx2（'θ'）##需要指定θ
#打印（gmcm_r.qgmm.marginal（u，θ））35;#需要在qgmm后更改网点
将（gmcm_r.qgmm_marginal（u，θ））打印到下划线
[,1]        [,2]
[1,]   8.660195  0.26664200
[2,]   7.626162  7.86828143
[3,]   7.862762  8.75474254
##[输出被截断]