Python rpy2错误-无（非缺失）观测值

我正在Ubuntu 1104上使用rpy2。我在看文件。文件中给出的步骤在R中。我必须使用rpy2在python中执行相同的步骤。 我没有得到任何关于rpy2的教程。我设法写了以下内容：

from rpy2.robjects.packages import importr
from rpy2.robjects import IntVector, Formula
import rpy2.robjects as ro
cox = importr("survival")
csv = ro.vectors.DataFrame.from_csvfile('Rossi.txt', header=True, sep=' ')
fmla = Formula('Surv(week, arrest) ~ fin + age + race + wexp + mar + paro + prio')
mod_aalison = cox.coxph (fmla, data=csv)

但我有以下错误

>>> mod_aalison = cox.coxph (fmla, data=csv)
Error in function (formula, data, weights, subset, na.action, init, control,  : 
  No (non-missing) observations
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/rpy2/robjects/functions.py", line 83, in __call__
    return super(SignatureTranslatedFunction, self).__call__(*args, **kwargs)
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/rpy2/robjects/functions.py", line 35, in __call__
    res = super(Function, self).__call__(*new_args, **new_kwargs)
rpy2.rinterface.RRuntimeError: Error in function (formula, data, weights, subset, na.action, init, control,  : 
  No (non-missing) observations

>>mod_aalison=cox.coxph（fmla，data=csv）
函数中的错误（公式、数据、权重、子集、na.action、init、control、：
无（非缺失）观察结果
回溯（最近一次呼叫最后一次）：
文件“”，第1行，在
文件“/usr/lib/python2.7/dist packages/rpy2/robjects/functions.py”，第83行，在调用中__
返回super（SignatureTranslatedFunction，self）。\调用（*args，**kwargs）
文件“/usr/lib/python2.7/dist packages/rpy2/robjects/functions.py”，第35行，在调用中__
res=super（函数，自）.\uuuuuuuuu调用（*新参数，**新参数）
rpy2.rinterface.rrontimeerror：函数中的错误（公式、数据、权重、子集、na.action、init、控件等）：
无（非缺失）观察结果

我遗漏了什么吗？我以前没有R方面的经验。 我不确定coxph函数中的if数据是否必须是数据帧格式。 感谢您的帮助

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这是指向

的链接。您使用

read.csv

读取数据，sep设置为单个空格，而文件有两个空格。这使R将其解释为存在空列，然后与列名混淆，最后在

coxph

中产生错误

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用

Read.table

读取数据，应该没问题。

嗨，mbq，你的ans的thnks。它工作了，救了我。还要指出的是，RPY2正在将列名更改为X.restart。这不应该发生。

>>打印csv.colnames[1]“X.week.”“X.restart.”“X.fin.”“X.age.”“X.race.”“X.wexp.”[7]“X.mar.”“X.paro”，“X.prio”，“X.educ”，“X.emp1”，“X.emp2”，“X.emp3”，“X.emp4”，“X.emp5”，“X.emp6”，“X.emp7”，“X.emp8。”

Me，我也使用

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