导入Cython模块时出现未定义的符号错误 我想把我的C++类之一作为Python模块。该类在头文件Foo.h中声明,并在.cppFoo.cpp中实现。 (g++-4.5,Ubuntu x86_64)。这是一个非常简单的类:
导入Cython模块时出现未定义的符号错误 我想把我的C++类之一作为Python模块。该类在头文件Foo.h中声明,并在.cppFoo.cpp中实现。 (g++-4.5,Ubuntu x86_64)。这是一个非常简单的类:,python,cython,distutils,undefined-reference,Python,Cython,Distutils,Undefined Reference,Foo.cpp: Foo::Foo() : alfa(1.0), beta(1) { } Foo::~Foo() { } Foo.h: class Foo { public: Foo() Foo(const Foo& orig); ~Foo(); double alfa; int beta; }; 我创建了一个setup.py,如Cython教程所示: setup.py from distutils.core import setup from d
Foo.cpp
:
Foo::Foo() : alfa(1.0), beta(1)
{
}
Foo::~Foo()
{
}
Foo.h
:
class Foo
{
public:
Foo()
Foo(const Foo& orig);
~Foo();
double alfa;
int beta;
};
我创建了一个setup.py
,如Cython教程所示:
setup.py
from distutils.core import setup
from distutils.extension import Extension
from Cython.Distutils import build_ext
setup(
name = 'MyDemo',
ext_modules=[
Extension("Foo"
sources=["Foo.pyx"],
include_dirs=[".","../eigen/"],
language="c++"),
],
cmdclass = {'build_ext': build_ext},
)
并按照cython教程的说明编写我的Foo.pyx
cython模块:
Foo.pyx
cdef extern from "Foo.h":
ctypedef struct c_Foo "Foo":
double alfa
c_Foo *new_Foo "new Foo" ()
void del_Foo "delete" (c_Foo *myfoo)
cdef class Foo:
cdef c_Foo *thisptr # hold a C++ instance which we're wrapping
def __cinit__(self):
self.thisptr = new_Foo()
def __dealloc__(self):
del_Foo(self.thisptr)
我使用以下命令编译它:
python setup.py build\u ext--inplace
running build_ext
skipping 'Foo.cpp' Cython extension (up-to-date)
building 'Foo extension
gcc -pthread -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -I. -I../eigen/ -I/usr/include/python2.6 -c Foo.cpp -o build/temp.linux-x86_64-2.6/Foo.o
cc1plus: warning: command line option "-Wstrict-prototypes" is valid for Ada/C/ObjC but not for C++
g++ -pthread -shared -Wl,-O1 -Wl,-Bsymbolic-functions build/temp.linux-x86_64-2.6/Foo.o -o /home/linello/prova/Foo.so
现在创建了Foo.so
共享库对象,但是当我想从python导入它时,我得到:
>>> import Foo
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
ImportError: ./Foo.so: undefined symbol: _ZN4FooD1Ev
>>>
导入Foo
回溯(最近一次呼叫最后一次):
文件“”,第1行,在
导入错误:./Foo.so:未定义符号:ZN4FooD1Ev
>>>
我认为\u ZN4FooD1Ev是Foo
的构造函数的损坏名称,但我不明白它是如何丢失符号的
我真的无法理解共享对象文件中缺少了什么符号。
作为第二点,在执行python setup.py build\u ext--inplace
命令之后,我的Foo.cpp
文件被弄乱了,并且包含了cythonized版本
如何以另一种格式(例如.cxx
)重命名cythonized文件并避免链接器错误
然后,我在pFoo.pyx
中修改了Foo.pyx
,并因此修改了setup.py
,现在在setup命令之后,我在Foo.cxx
中获得了pFoo.pyx
的cythonized版本,但当我尝试导入时,我得到了
ImportError:动态模块未定义初始化函数(initpyFoo)
我的设置有什么问题?如何解决我的问题?我建议您为cython模块使用不同的名称,例如cFoo,以避免名称冲突问题:
from distutils.core import setup
from Cython.Build import cythonize
setup(ext_modules = cythonize(
"cFoo.pyx", # our Cython source
sources=["Foo.cpp"], # additional source file(s)
language="c++", # generate C++ code
))
< P>定义C++类,使用“CPPPCYPE”关键字,如下:
cdef extern from "Foo.h":
cdef cppclass Foo:
Foo()
double alfa
int beta
然后,您应该能够像这样访问您的类:
cdef Foo *foo = new Foo()
foo.beta = 42
Foo类是否在cpp文件中定义了它的复制构造函数?不,它实际上没有定义复制构造函数,当在
pyFoo.pyx
中定义并重命名Foo.pyx
时,我解决了这个问题。