Python 获取genfromtxt/loadtxt以忽略被忽略列/行中的数据类型

我有一个包含整数数据的文件，其中前几行/列用于名称

我希望能够使用

genfromtxt

或

loadtxt

并且仍然能够让numpy将其作为一个同质数组来读取。为此，我使用了选项

skiprows

和

usecols

，但没有帮助。 在下面的（工作）示例中，我希望

print（test\u array.shape）

给出（3,3）和

print（test.array）

给出

[[0 0 0]
 [0 1 0]
 [1 0 0]]

在尝试加载文件之前，是否有任何方法可以在不修剪第一行/第一列的情况下实现我想要的结果？请注意，我要加载的实际文件是B-I-G（~6 gigs），因此任何解决方案都不应该过于计算密集

from __future__ import print_function
from StringIO import StringIO #use io.StringIO with py3
import numpy as np

example_file = StringIO("FID 1 2 3\n11464_ATCACG 0 0 0\n11465_CGATGT 0 1 0\n11466_TTAGGC 1 0 0")
test_array = np.loadtxt(example_file, skiprows=1, usecols=(1,), dtype=int)

print(test_array.shape) #(3,)
print(test_array) #[0 0 1]

---

您可以使用

np.genfromtxt

中的

usecols

和

skip_header

标志。那么它的工作原理是：

test_array = np.genfromtxt(example_file, skip_header=1, usecols=(1,2,3))
>>> print(test_array)
[[ 0.  0.  0.]
 [ 0.  1.  0.]
 [ 1.  0.  0.]]

---

您可以使用

np.genfromtxt

中的

usecols

和

skip_header

标志。那么它的工作原理是：

test_array = np.genfromtxt(example_file, skip_header=1, usecols=(1,2,3))
>>> print(test_array)
[[ 0.  0.  0.]
 [ 0.  1.  0.]
 [ 1.  0.  0.]]