使用importr从Python中的R包中调用函数

我在R中使用了一个名为MRE的特性选择算法，但我需要从Python中调用它。我已经成功地安装了这个包，并且能够从Python调用它。我需要访问R mRMRe包中的一些函数，如mRMR.data，以将数据帧转换为algo所需的格式

from rpy2.robjects.packages import importr
utils = importr('utils') #-- Only once.
utils.install_packages('mRMRe')

# Now we begin by loading in the R packages
pymRMR = importr('mRMRe')

pymRMR
Out[53]: rpy2.robjects.packages.Package as a <module 'mRMRe'>

如果我尝试使用不同的库，情况也是如此：

datasets = importr('datasets')
datasets.data.fetch('mtcars')
Traceback (most recent call last):

  File "<ipython-input-56-b036c6da58e1>", line 2, in <module>
    datasets.data.fetch('mtcars')

AttributeError: module 'datasets' has no attribute 'data'

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有人能帮我解决这个问题吗？

您只导入基本模块，需要完全导入。你可能会认为Python会自动做到这一点，显然它不会。看

编辑：啊，是的，这适用于显式python模块。我认为调用子包函数的语法可能不同。试试这个

import rpy2.robjects.packages as packages
datasets = packages.importr('datasets')
mtcars = packages.data(datasets).fetch('mtcars')['mtcars']

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我曾经导入一些R包并在python代码中使用它们，但最近我临时提出了一种方法，您可以简单地使用R代码并为其提供所需的任务。看看这里，它对你的情况很有用

@ShuvayanDas看看新语法是否有用。我为我装了

mtcars

。

import rpy2.robjects as ro
#now import the importr() method
from rpy2.robjects.packages import importr
utils = importr('utils') #-- Only once.
utils.install_packages('mrfDepth')
# Now we begin by loading in the R packages
mrfdepth = importr('mrfDepth')
mc = mrfdepth.medcouple(yr)[0]
return mc

from mRMRr import *
from datasets import *

import rpy2.robjects.packages as packages
datasets = packages.importr('datasets')
mtcars = packages.data(datasets).fetch('mtcars')['mtcars']