Python 如何加速对数百万行的多个str.contains搜索?

Python 如何加速对数百万行的多个str.contains搜索?,python,regex,pandas,Python,Regex,Pandas,我有一个商店名称的数据框架,我正试图将其标准化。此处要测试的小样本: import pandas as pd df = pd.DataFrame({'store': pd.Series(['McDonalds', 'Lidls', 'Lidl New York 123', 'KFC', 'Lidi Berlin', 'Wallmart LA 90210', 'Aldi', 'London Lidl', 'Aldi627', 'mcdonaldsabc123', 'Mcdonald_s', 'M

我有一个商店名称的数据框架,我正试图将其标准化。此处要测试的小样本:

import pandas as pd

df = pd.DataFrame({'store': pd.Series(['McDonalds', 'Lidls', 'Lidl New York 123', 'KFC', 'Lidi Berlin', 'Wallmart LA 90210', 'Aldi', 'London Lidl', 'Aldi627', 'mcdonaldsabc123', 'Mcdonald_s', 'McDonalds12345', 'McDonalds5555', 'McDonalds888', 'Aldi123', 'KFC-786', 'KFC-908', 'McDonalds511', 'GerALDInes Shop'],dtype='object',index=pd.RangeIndex(start=0, stop=19, step=1)), 'standard': pd.Series([pd.np.nan, pd.np.nan, pd.np.nan, pd.np.nan, pd.np.nan, pd.np.nan, pd.np.nan, pd.np.nan, pd.np.nan, pd.np.nan, pd.np.nan, pd.np.nan, pd.np.nan, pd.np.nan, pd.np.nan, pd.np.nan, pd.np.nan, pd.np.nan, pd.np.nan],dtype='float64',index=pd.RangeIndex(start=0, stop=19, step=1))}, index=pd.RangeIndex(start=0, stop=19, step=1))

                store  standard
0           McDonalds       NaN
1               Lidls       NaN
2   Lidl New York 123       NaN
3                 KFC       NaN
4         Lidi Berlin       NaN
5   Wallmart LA 90210       NaN
6                Aldi       NaN
7         London Lidl       NaN
8             Aldi627       NaN
9     mcdonaldsabc123       NaN
10         Mcdonald_s       NaN
11     McDonalds12345       NaN
12      McDonalds5555       NaN
13       McDonalds888       NaN
14            Aldi123       NaN
15            KFC-786       NaN
16            KFC-908       NaN
17       McDonalds511       NaN
18    GerALDInes Shop       NaN
我设置了一个regex字典来搜索字符串,并在
standard
列中插入了商店名称的标准版本。这适用于这个小数据帧:

# set up the dictionary
regex_dict = {
 "McDonalds": r'(mcdonalds|mcdonald_s)',
 "Lidl" : r'(lidl|lidi)',
 "Wallmart":r'wallmart',
 "KFC": r'KFC',
 "Aldi":r'(\baldi\b|\baldi\d+)'
}

# loop through dictionary, using str.replace 
for regname, regex_formula in regex_dict.items(): 

    df.loc[df['store'].str.contains(regex_formula,na=False,flags=re.I), 'standard'] = regname

print(df)

                store   standard
0           McDonalds  McDonalds
1               Lidls       Lidl
2   Lidl New York 123       Lidl
3                 KFC        KFC
4         Lidi Berlin       Lidl
5   Wallmart LA 90210   Wallmart
6                Aldi       Aldi
7         London Lidl       Lidl
8             Aldi627       Aldi
9     mcdonaldsabc123  McDonalds
10         Mcdonald_s  McDonalds
11     McDonalds12345  McDonalds
12      McDonalds5555  McDonalds
13       McDonalds888  McDonalds
14            Aldi123       Aldi
15            KFC-786        KFC
16            KFC-908        KFC
17       McDonalds511  McDonalds
18    GerALDInes Shop        NaN
问题是我有大约600万行需要标准化,其中一个regex字典比这里显示的要大得多。(许多不同的店名有一些拼写错误等)

我想做的是在每个循环中,只对未标准化的行使用
str.contains
,而忽略已标准化的行。其思想是减少每个循环的搜索空间,从而减少总体处理时间

我已经通过
standard
列测试了索引,仅对
standard
Nan
的行执行
str.contains
,但这不会导致任何实际的加速。在应用
str.contains
之前,仍然需要时间来确定哪些行是
Nan

以下是我试图减少每个循环的处理时间的内容:

for regname, regex_formula in regex_dict.items(): 

    # only apply str.contains to rows where standard == NAN
    df.loc[df['standard'].isnull() & df['store'].str.contains(regex_formula,na=False,flags=re.I), 'standard'] = regname
这很有效。。但是在我的600万行中使用这个并没有真正的速度差异


在一个600万行的数据帧上,是否有可能加快速度

另一种方法是先提取组,然后像下面那样替换,循环方法仍然更好

我们需要稍微修改一下正则表达式

regex_dict = {
 r'mcdonalds|mcdonald_s':"McDonalds",
 r'lidl|lidi':"Lidl",
 r'wallmart': "Wallmart",
 r'kfc':"KFC" ,
 r'aldi|aldi':"Aldi"
}

df.str.extract(r'('+ '|'.join(regex_dict.keys())+')',expand=False).replace(regex_dict,regex=True)
0    McDonalds
1         Lidl
2         Lidl
3          KFC
4         Lidl

我设法用这个减少了40%的时间。尽我所能

我创建了一个名为
fixed_df
的空数据帧来附加新的标准行,然后在每个循环结束时删除原始数据帧中的相同行。随着每个商店的标准化,每个循环的搜索空间都会减少,而
fixed_df
的大小会随着每个循环的增加而增加。最后,
fixed_df
应该有所有的原始行,现在已经标准化,并且原始df应该是空的

# create empty df to store new results
fixed_df = pd.DataFrame()

# loop through dictionary
for regname, regex_formula in regex_dict.items(): 

    # search for regex formula, add standardized name into standard column
    df.loc[df['term_location'].str.contains(regex_formula,na=False,flags=re.I), 'standard'] = regname

    # get index of where names were fixed
    ind = df[df['standard']==regname].index

    # append fixed data to new df
    fixed_df.append(df[df.index.isin(ind)].copy())

    # remove processed stuff from original df
    df = df[~df.index.isin(ind)].copy()

.str访问器是非常循环的。您最好使用列表理解。我认为
str.contains
是一种快速且矢量化的字符串搜索方法?但我绝对不是熊猫或蟒蛇专家。你有列表理解版本的例子吗?如果有成百上千的搜索词,
r'(“+”|“.join(regex_dict.keys())+”
,如果它们在同一位置匹配,那么会大大降低代码的执行速度。你应该总是避免类似的选择。