python子进程

我通常在Linux中（手动）执行Fortran文件，如下所示：

连接到服务器

转到特定文件夹

ifort xxx.for-o xxx&./xxx

（其中“xxx.for”是我的Fortran文件，“xxx”是Fortran可执行文件）

但是我需要从python（我是初学者）调用我的fortran文件（xxx.for），所以我使用了

subprocess

和以下命令：

cmd = ["ssh", sshConnect, "cd %s;"%(workDir), Fortrancmd %s jobname "%s -o  %s" exeFilename "%s && %s ./ %s%s"%(exeFilename)]

但是我犯了一个错误，我不确定是什么错了。以下是完整的代码：

import string
import subprocess as subProc
from subprocess import Popen as ProcOpen
from subprocess import PIPE
import numpy
import subprocess

userID = "pear"
serverName = "say4"
workDir = "/home/pear/2/W/fortran/"
Fortrancmd = "ifort"
jobname = "rad.for"
exeFilename = "rad"

sshConnect=userID+"@"+servername

cmd=["ssh", sshConnect, "cd %s;"%(workDir), Fortrancmd %s jobname "%s -o  %s" exeFilename "%s && %s ./ %s%s"%(exeFilename)]

**#command to execute fortran files in Linux
**#ifort <filename>.for -o <filename> && ./<filename> (press enter)

**#example:ifort xxx.for -o xxx && ./xxx (press enter)

print cmd

导入字符串
将子流程作为SubPC导入
从子流程导入Popen作为ProcOpen
从子流程导入管道
进口numpy
导入子流程
userID=“pear”
serverName=“say4”
workDir=“/home/pear/2/W/fortran/”
Fortrancmd=“ifort”
jobname=“rad.for”
exeFilename=“rad”
sshConnect=userID+“@”+servername
cmd=[“ssh”，sshConnect，“cd%s；”%（workDir），Fortrancmd%s作业名“%s-o%s”exeFilename“%s&&%s./%s%s”%（exeFilename）]
**#在Linux中执行fortran文件的命令
**#ifort.for-o&&./（按enter键）
**#示例：ifort xxx.for-o xxx&./xxx（按enter键）
打印命令

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如何编写一个python程序来执行上述所有3个步骤并避免出现错误？

您必须使用python吗

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sshuser@host“命令”

用于您可能要查看的手动部分或windows。这些允许您在交互条件下执行子流程和传递输入

不过，您正在做的大部分工作听起来都可以在shell脚本中正常工作。为简单起见，您可以在服务器端为服务器端操作生成一个shell脚本，然后插入ssh语句中的路径：

ssh user@host "/path/to/script.sh"

一个错误：

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您的参数列表中有一个未加引号的%s，因此字符串格式设置将失败。

有一些语法错误

原件：

cmd=["ssh", sshConnect, "cd %s;"%(workDir), Fortrancmd %s jobname "%s -o  %s" exeFilename "%s && %s ./ %s%s"%(exeFilename)]

我想你的意思是：

cmd = [
      "ssh",
      sshConnect,
      "cd %s;" % (workDir,),
      "%s %s -o  %s && ./%s" % (Fortrancmd, jobname, exeFilename, exeFilename)
      ]

请注意：

• 具有一个元素的元组需要在第一个参数（请参见workDir，）的末尾加一个逗号，才能将其解释为元组（与简单的操作顺序参数相比）
• 使用单个字符串格式操作可能更容易构造fortan命令

PS-为了可读性，通常最好将长列表分成多行：）

我的建议

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我建议查看而不是使用子流程，下面是一个使用子流程模块通过ssh（在本例中是一个简单的回显）运行远程命令并获取结果的完整示例，希望有帮助：

>>> import subprocess
>>> proc = subprocess.Popen(("ssh", "remoteuser@host", "echo", "1"), stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.PIPE)
>>> stdout, stderr = proc.communicate()

在本例中返回：（'1\n'，''）

请注意，要在不需要密码的情况下实现此功能，您可能需要将本地用户的公钥添加到远程计算机上的~remoteuser/.ssh/authorized_密钥。

您可以在步骤1和2中使用。 这是基本思想：

from fabric.api import *
env.hosts = ['host']
dir = '/home/...'

def compile(file):
     with cd(dir):
         run("ifort %s.for -o %s" %(file,file))
         run("./%s > stdout.txt" % file)

• 创建fabfile.py
• 然后运行

  fab compile:filename