Python 修剪/winsorized标准偏差
什么是计算列表的平均值或标准偏差的有效方法Python 修剪/winsorized标准偏差,python,numpy,statistics,python-3.x,scipy,Python,Numpy,Statistics,Python 3.x,Scipy,什么是计算列表的平均值或标准偏差的有效方法 我不介意使用numpy,但是如果我必须单独复制列表,它会非常慢。这就是生成器函数的用途 SD需要两次通过,再加上一次计数。因此,您需要在基集合上“tee”一些迭代器 所以 trimmed=(如果低这将生成两个副本,那么在_列表中x代表x),但是您应该尝试一下,因为它应该非常快 def trimmed_std(data, low, high): tmp = np.asarray(data) return tmp[(low <= tm
我不介意使用
numpy
,但是如果我必须单独复制列表,它会非常慢。这就是生成器函数的用途
SD需要两次通过,再加上一次计数。因此,您需要在基集合上“tee”一些迭代器
所以
trimmed=(如果低这将生成两个副本,那么在_列表中x代表x),但是您应该尝试一下,因为它应该非常快
def trimmed_std(data, low, high):
tmp = np.asarray(data)
return tmp[(low <= tmp) & (tmp < high)].std()
显然,您可以在不使用numpy的情况下实现这一点,但即使包括将列表转换为数组的时间,使用numpy也比我所能想到的任何方法都要快。为了获得无偏的修剪平均值,您必须考虑列表中项目的小数位,如前所述和(稍微不那么直接).我写了一个函数来实现它:
def percent_tmean( data, pcent ):
# make sure data is a list
dc = list( data )
# find the number of items
n = len(dc)
# sort the list
dc.sort()
# get the proportion to trim
p = pcent / 100.0
k = n*p
# print "n = %i\np = %.3f\nk = %.3f" % ( n,p,k )
# get the decimal and integer parts of k
dec_part, int_part = modf( k )
# get an index we can use
index = int(int_part)
# trim down the list
dc = dc[ index: index * -1 ]
# deal with the case of trimming fractional items
if dec_part != 0.0:
# deal with the first remaining item
dc[ 0 ] = dc[ 0 ] * (1 - dec_part)
# deal with last remaining item
dc[ -1 ] = dc[ -1 ] * (1 - dec_part)
return sum( dc ) / ( n - 2.0*k )
我还做了一个演示
我的函数可能会比那些已经发布的函数慢,但它会给出无偏的结果。是的,我需要进行排名顺序(百分位)修剪。这就是我特别关注时间的原因:我需要再次传递,以确定保留原始列表中的哪些值。确实如此,但不知何故,它比复制到numpy数组慢8倍:(我想常规的python开销会比副本慢很多…慢8倍!这非常清楚地显示了numpy
的价值。
def trimmed_std(data, percentile):
data = np.array(data)
data.sort()
percentile = percentile / 2.
low = int(percentile * len(data))
high = int((1. - percentile) * len(data))
return data[low:high].std(ddof=0)
def percent_tmean( data, pcent ):
# make sure data is a list
dc = list( data )
# find the number of items
n = len(dc)
# sort the list
dc.sort()
# get the proportion to trim
p = pcent / 100.0
k = n*p
# print "n = %i\np = %.3f\nk = %.3f" % ( n,p,k )
# get the decimal and integer parts of k
dec_part, int_part = modf( k )
# get an index we can use
index = int(int_part)
# trim down the list
dc = dc[ index: index * -1 ]
# deal with the case of trimming fractional items
if dec_part != 0.0:
# deal with the first remaining item
dc[ 0 ] = dc[ 0 ] * (1 - dec_part)
# deal with last remaining item
dc[ -1 ] = dc[ -1 ] * (1 - dec_part)
return sum( dc ) / ( n - 2.0*k )