Python 如何在Ubuntu上安装和使用rpy2

我正在尝试使用Python通过rpy2调用R。我正在Ubuntu 15.10上工作。我已经安装了Python 3.5.1，作为Anaconda 2.4.1（64位）、R和rpy2 2.7.6版的一部分。当我在终端上尝试$python-m'rpy2.tests'时，出现以下错误：

Traceback (most recent call last):
  File "/home/thirsty/anaconda3/lib/python3.5/runpy.py", line 170, in    _run_module_as_main
    "__main__", mod_spec)
  File "/home/thirsty/anaconda3/lib/python3.5/runpy.py", line 85, in _run_code
    exec(code, run_globals)
  File "/home/thirsty/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/rpy2/tests.py",   line 23, in <module>
    import rpy2.tests_rpy_classic
  File "/home/thirsty/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/rpy2/tests_rpy_classic.py", line 3, in <module>
    import rpy2.rpy_classic as rpy
  File "/home/thirsty/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/rpy2/rpy_classic.py", line 5, in <module>
    import rpy2.rinterface as ri
  File "/home/thirsty/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/rpy2/rinterface/__init__.py", line 99, in <module>
    from rpy2.rinterface._rinterface import *
ImportError: /home/thirsty/anaconda3/bin/../lib/libreadline.so.6: undefined symbol: PC

回溯（最近一次呼叫最后一次）：
文件“/home/quirty/anaconda3/lib/python3.5/runpy.py”，第170行，在运行模块中作为主模块
“\uuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuu
文件“/home/quirty/anaconda3/lib/python3.5/runpy.py”，第85行，在运行代码中
exec（代码、运行\全局）
文件“/home/quarty/anaconda3/lib/python3.5/site packages/rpy2/tests.py”，第23行，在
导入rpy2.tests\u rpy\u classic
文件“/home/quirty/anaconda3/lib/python3.5/site packages/rpy2/tests\u rpy\u classic.py”，第3行，在
导入rpy2.rpy_classic作为rpy
文件“/home/quirty/anaconda3/lib/python3.5/site packages/rpy2/rpy_classic.py”，第5行，在
将rpy2.rinterface导入为ri
文件“/home/quirty/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/rpy2/rinterface/__-init___.py”，第99行，在
从rpy2.rinterface.\u rinterface导入*
ImportError:/home/quirty/anaconda3/bin/./lib/libreadline.so.6：未定义符号：PC

我已经解决了这个问题。python、rpy2的版本很好。可能命令$python-m'rpy2.tests'不是测试rpy2的正确方法。启动Pythonshell后，当我键入import rpy2.robjects作为robjects时，它工作正常，没有任何错误，并且我能够使用R读取文件。

我的服务器不是Ubuntu，而是CentOS 6.6版（最终版）。我用这种方法解决了这个问题，我想你可以在Ubuntu中找到相应的文件

cp /lib64/libreadline.so.6 ~/anaconda3/lib/libreadline.so.6

完成了。祝你好运

但顺便说一句，如果您不能安装rpy2，系统会告诉您需要安装Cython，然后

pip uninstall Cython
pip install Cython

祝你好运

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同样，不要同时在服务器中安装Anaconda2和Anaconda3，只需使用其中任何一个，然后更改环境

实际上，

rpy2

是python

.py

脚本中使用的一个模块，与其他任何脚本一样：pandas、numpy、lxml、csv等等。