Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/2/python/310.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

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Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181
Python 按行列出的Seaborn热图颜色_Python_Matplotlib_Seaborn_Heatmap - Fatal编程技术网

Python 按行列出的Seaborn热图颜色

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我有一张网络图

每个节点都是一个案例,每个边都是一个CPT

我使用community.best_分区将图形分成四个由颜色标注的社区

为了更好地可视化每个社区中共享的CPT和案例量,我使用plt.subplot和sns.heatmap创建了四个社区之间具有相似匹配颜色的热图

生成热图的代码:

fig, axs = plt.subplots(nrows=4, figsize=(16,8), sharex=True)

cmaps = ['Blues', 'Oranges', 'Greens', 'Reds']

comms = range(4)

for ax, cmap, comm in zip(axs, cmaps, comms):
    sns.heatmap(
        data=_.loc[[comm]],
        ax=ax,
        cmap=cmap,
        annot=True,
        annot_kws={
            'fontsize' : 12
        },
        fmt='g',
        cbar=False,
        robust=True,
    )

    ax.set_ylabel('Community')

    ax.set_xlabel('');
问题:

在sns.heatmap中是否有办法按行指定颜色在这种情况下,社区不必创建4个单独的热图

以下是一些示例数据:

cpt   52320  52353  52310  49568  50432  52234  52317  50435  52354  52332
comm                                                                      
0       NaN    3.0    NaN    1.0    1.0    NaN    2.0    2.0    NaN    3.0
1       1.0   30.0    NaN    NaN    NaN    1.0    NaN    NaN    NaN   20.0
2       NaN    NaN  160.0    NaN    NaN    NaN    NaN    NaN    NaN    NaN
3       NaN    7.0    NaN    NaN    NaN    NaN    NaN    NaN    1.0   12.0

我认为使用seaborn的热图无法做到这一点,但可以使用imshow重新创建输出


我认为使用seaborn的热图无法做到这一点,但可以使用imshow重新创建输出


请注意,社区2中的值160几乎不可见。这是因为样本数据中只有一个值?没错,如果行中只有一个值,或者如果所有值都相等,那么代码就不是很健壮。我已经用一个额外的测试修改了我的答案,以考虑到这种可能性。请注意,您可能希望使用ax.annotatef'{val:.0f}'。。或者类似的方法来避免拖尾。0。当单元格变得太窄时,可以添加ax.annotate…,rotation=90注意到社区2中的值160几乎不可见。这是因为样本数据中只有一个值?没错,如果行中只有一个值,或者如果所有值都相等,那么代码就不是很健壮。我已经用一个额外的测试修改了我的答案,以考虑到这种可能性。请注意,您可能希望使用ax.annotatef'{val:.0f}'。。或者类似的方法来避免拖尾。0。当单元格太窄时,可以添加ax.annotate…,旋转=90
d = """      52320  52353  52310  49568  50432  52234  52317  50435  52354  52332                                                                     
0       NaN    3.0    NaN    1.0    1.0    NaN    2.0    2.0    NaN    3.0
1       1.0   30.0    NaN    NaN    NaN    1.0    NaN    NaN    NaN   20.0
2       NaN    NaN  160.0    NaN    NaN    NaN    NaN    NaN    NaN    NaN
3       NaN    7.0    NaN    NaN    NaN    NaN    NaN    NaN    1.0   12.0"""
df = pd.read_csv(StringIO(d), sep='\\s+')

N_communities = df.index.size
N_cols = df.columns.size
cmaps = ['Blues', 'Oranges', 'Greens', 'Reds']

fig, ax = plt.subplots()

for i,((idx,row),cmap) in enumerate(zip(df.iterrows(), cmaps)):
    ax.imshow(np.vstack([row.values, row.values]), aspect='auto', extent=[-0.5,N_cols-0.5,i,i+1], cmap=cmap)
    for j,val in enumerate(row.values):
        vmin, vmax = row.agg(['min','max'])
        vmid = (vmax-vmin)/2
        if not np.isnan(val):
            ax.annotate(val, xy=(j,i+0.5), ha='center', va='center', color='black' if (val<=vmid or vmin==vmax) else 'white')
ax.set_ylim(0,N_communities)

ax.set_xticks(range(N_cols))
ax.set_xticklabels(df.columns, rotation=90, ha='center')

ax.set_yticks(0.5+np.arange(N_communities))
ax.set_yticklabels(df.index)
ax.set_ylabel('Community')

ax.invert_yaxis()

fig.tight_layout()