Python：动态区间数据结构

我正在寻找一些python代码来有效地计算间隔重叠。 我以前使用过bx python包的间隔树，但是现在需要从树中删除间隔（或者更好的是，修改它们）。 bx python树似乎不支持这一点

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有指针吗？

也许存储所有交叉点间隔会有所帮助

你需要：

• 所有间隔的并集边界
• 对于每个交叉点，左边界和交叉点的间隔列表

交叉点间隔可以存储在树中，因为它们仅用左边界表示。插入和删除间隔的方法类似（简化）：

插入：查找新区间左右边界的交点区间，将这些交点区间拆分为2或3个新交点区间。对于每个相交间隔，将指针添加到新间隔

删除：查找左右边界的相交间隔，将它们合并到之前的相交间隔。对于每个相交间隔，请将指针移到已删除间隔。

支持从树中删除间隔。例如，要从间隔列表中删除最小数量的间隔，以便剩余的间隔不会在

O（n log n）

中重叠，可以使用

banyan.SortedSet

（增强红黑树）：

from banyan import SortedSet, OverlappingIntervalsUpdator # pip install banyan

def maximize_nonoverlapping_count(intervals):
    # build "interval" tree sorted by the end-point O(n log n)
    tree = SortedSet(intervals, key=lambda (start, end): (end, (end - start)),
                     updator=OverlappingIntervalsUpdator)
    result = []
    while tree: # until there are intervals left to consider
        # pop the interval with the smallest end-point, keep it in the result
        result.append(tree.pop()) # O(log n)

        # remove intervals that overlap with the popped interval
        overlapping_intervals = tree.overlap(result[-1]) # O(m log n)
        tree -= overlapping_intervals # O(m log n)
    return result

例如：

print maximize_nonoverlapping_count([[3, 4], [5, 8], [0, 6], [1, 2]])
# -> [[1, 2], [3, 4], [5, 8]]

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参阅

< p>如果你正在寻找一个处理间隔算法的Python库，考虑一下。免责声明：我是该库的维护者

该库支持检查重叠，并自动合并间隔。例如：

>>> import intervals as I
>>> I.closed(1,2) | I.closed(2,3)
[1,3]
>>> I.closed(1,2).overlaps(I.closed(3,4))
False

如果要专门计算重叠，请执行以下操作：

>>> I.closed(1,3) & I.closed(2, 4)
[2,3]

它支持有限或无限的开/闭区间。要删除给定间隔，只需使用差分运算符：

>>> I.closed(1, 4) - I.closed(2, 3)
[1,2) | (3,4]

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如果你能更具体一点，我可以帮你

我最近需要这样做，并决定在一个（红/黑）btree中使用一组

（start，length）

对，由

start

（用C编写，带有Python绑定）索引。然后我意识到，在我的例子中，位图将是足够有效的，当然位图实现相对来说是微不足道的。这对你有用吗？谢谢你的回复！在我的例子中，事情更复杂一些，因为我需要将数据附加到每个间隔，当间隔被更改或合并时，我也需要更改/合并相应的数据。不确定保持从位数组区域到数据的映射是否容易/高效。在树中，我只需将数据存储在节点中。我看到您的库仅限于整数、浮点以及其他默认变量类型。但我发现这个库在版本控制方面有着惊人的用途。例如，I.openclosed（1.2.1,1.3.2）将是（1.2.1,1.3.2），并且将包含从1.2.1.x、>1.2.2到1.3.2的所有内容。它不限于整数或浮点数，而是允许将任何可比较的值存储为边界。这很有趣，您建议使用版本作为边界，因为这正是我最初创建此库的原因；-）我需要一种统一的方法来编码不同包装生态系统中使用的依赖约束，最简单的方法是将所有这些约束转换为间隔（当时我没有找到一个库来处理这些间隔）。这太棒了。我想知道你是否有版本控制库的开源版本。我试着用我自己的和你的。我得到AttributeError的AttributeError:“\u PInf”对象没有属性“vlist”vlist这里是我的版本控制类中的一个对象，它是从版本字符串派生的。请查看此处：