Python PySpark:一步计算平均值、标准偏差和平均值周围的值

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我的原始数据是表格格式的。它包含来自不同变量的观察结果。每个观察都带有变量名、时间戳和当时的值

变量[字符串]、时间[日期时间]、值[浮点]

数据以拼花地板的形式存储在HDFS中,并加载到Spark数据帧(df)中。从那个数据帧

现在,我想计算每个变量的默认统计数据,如平均值、标准偏差和其他。之后,一旦检索到平均值,我想过滤/计算与平均值密切相关的变量值

基于对我的答案,我提出了以下代码:

from pyspark.sql.window import Window
from pyspark.sql.functions import *
from pyspark.sql.types import *

w1 = Window().partitionBy("Variable")
w2 = Window.partitionBy("Variable").orderBy("Time")

def stddev_pop_w(col, w):
    #Built-in stddev doesn't support windowing
    return sqrt(avg(col * col).over(w) - pow(avg(col).over(w), 2))

def isInRange(value, mean, stddev, radius):
    try:
        if (abs(value - mean) < radius * stddev):
            return 1
        else:
            return 0
    except AttributeError:
        return -1

delta = col("Time").cast("long") - lag("Time", 1).over(w2).cast("long")
#f = udf(lambda (value, mean, stddev, radius): abs(value - mean) < radius * stddev, IntegerType())
#f2 = udf(lambda value, mean, stddev: isInRange(value, mean, stddev, 2), IntegerType())
#f3 = udf(lambda value, mean, stddev: isInRange(value, mean, stddev, 3), IntegerType())

df_ = df_all \
    .withColumn("mean", mean("Value").over(w1)) \
    .withColumn("std_deviation", stddev_pop_w(col("Value"), w1)) \
    .withColumn("delta", delta) \
#    .withColumn("stddev_2", f2("Value", "mean", "std_deviation")) \
#    .withColumn("stddev_3", f3("Value", "mean", "std_deviation")) \

#df2.show(5, False)
从pyspark.sql.window导入窗口
从pyspark.sql.functions导入*
从pyspark.sql.types导入*
w1=窗口().partitionBy(“变量”)
w2=窗口.partitionBy(“变量”).orderBy(“时间”)
def STDEV_pop_w(列,w):
#内置stddev不支持窗口设置
返回sqrt(平均(柱*柱)。超过(w)-功率(平均(柱)。超过(w),2))
def isInRange(值、平均值、标准差、半径):
尝试:
如果(abs(值-平均值)<半径*标准差):
返回1
其他:
返回0
除属性错误外:
返回-1
delta=col(“Time”).cast(“long”)-lag(“Time”,1)。over(w2)。cast(“long”)
#f=udf(λ(值、平均值、标准差、半径):abs(值-平均值)
问题:最后两行注释无效。它将给出AttributeError,因为stddev和mean的传入值为null。我猜这是因为我所指的列也是动态计算的,在那个时刻没有任何值但是有没有办法做到这一点呢?

目前,我正在进行第二次跑步,如下所示:

df = df_.select("*", \
    abs(df_.Value - df_.mean).alias("max_deviation_mean"), \
    when(abs(df_.Value - df_.mean) < 2 * df_.std_deviation, 1).otherwise(1).alias("std_dev_mean_2"), \
    when(abs(df_.Value - df_.mean) < 3 * df_.std_deviation, 1).otherwise(1).alias("std_dev_mean_3"))
df=df\选择(“*”\
abs(偏差值-偏差平均值)。别名(“最大偏差平均值”)\
当(abs(df_u.值-df_u.平均值)<2*df_u.标准偏差,1)。否则(1)。别名(“标准偏差平均值2”)\
当(abs(df_u.值-df_u.平均值)<3*df_u.标准偏差,1)。否则(1)。别名(“标准偏差平均值3”))

这无法工作,因为当您执行

from pyspark.sql.functions import *
您可以使用
pyspark.sql.functions.abs
对内置的
abs
进行阴影处理,它需要一个列而不是本地Python值作为输入

另外,您创建的自定义项不处理
NULL
条目

  • 不要使用
    import*
    ,除非您知道导入的确切内容。取而代之的是别名

    from pyspark.sql.functions import abs as abs_
    
    或导入模块

    from pyspark.sql import functions as sqlf
    
    sqlf.col("x")
    
  • 始终检查UDF内的输入,除非必要,否则最好避免使用UDF


解决方案是使用DataFrame.aggregateByKey函数,在计算节点周围将每个分区和节点的值聚合,然后将这些值组合为一个结果值

伪代码如下所示。它的灵感来自,但它使用了StatCounter的两个实例,尽管我们同时总结了两个不同的统计数据:

from pyspark.statcounter import StatCounter
# value[0] is the timestamp and value[1] is the float-value
# we are using two instances of StatCounter to sum-up two different statistics

def mergeValues(s1, v1, s2, v2):
    s1.merge(v1)
    s2.merge(v2)
    return

def combineStats(s1, s2):
    s1[0].mergeStats(s2[0])
    s1[1].mergeStats(s2[1])
    return
(df.aggregateByKey((StatCounter(), StatCounter()),
        (lambda s, values: mergeValues(s[0], values[0], s[1], values[1]),
        (lambda s1, s2: combineStats(s1, s2))
    .mapValues(lambda s: (  s[0].min(), s[0].max(), s[1].max(), s[1].min(), s[1].mean(), s[1].variance(), s[1].stddev,() s[1].count()))
    .collect())

你是说当我更改导入时它会工作?我是说这和缺少NULL/None处理是明显的问题。可能还有其他问题。