Python中的差异基因表达分析

似乎RNA-Seq的大多数差异基因表达包都是用R

Examples include:

- edgeR
- limma
- DESeq

Python是否有类似（且易于使用）的包，或者是否有R包被移植

我能找到的最好的答案是：

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但我真的不想使用rpy2（第一链接）。第二个环节可能是我要开始的地方，但我首先要确保我没有重新发明方向盘。

为什么要投反对票？如果您有更好的解决方案，请务必发布它们，但对我来说，子流程并不是非常Python式的。子流程完全是Python式的imho，因为Python是用于脚本和管道的优秀语言。你想让你的生活更艰难。为什么会有否决票。否决票的可能原因：

要求我们推荐或查找书籍、工具、软件库、教程或其他非网站资源的问题会导致堆栈溢出，因为它们往往会吸引自以为是的答案和垃圾邮件我还想附和OP的问题，老实说，这似乎是一个对我来说并不离题的特定问题：要么有Python中的工具来完成这项工作（在这种情况下，所有的输入仍然受到赞赏），要么没有