Python 如何使两个或两个以上的特定字母组合？

我是python的新手，上个星期我一直在努力解决这个问题，有人能帮我解决这个问题吗？这对完成我的项目非常有帮助

我尝试根据给定序列的用户输入进行单突变及其2,3组合：

2C
   PrAwCEL 
   PrACCgL 
   PEAwCgL 
3C
   PrAwCgL 

输入顺序：>PEACCEL

用户输入文件： E2R C4W E6G

这是我程序的一部分，我将2,4,6中的R，W，G替换为E，C，E，然后将替换的字母存储到变量R中，该变量包含如下三行：-

PrACCEL
PEAwCEL
PEACCgL

现在，我想把这三个单突变组合成2和3。 这就像一行中两个突变和一行中三个突变的组合

样本和预期输出如下所示：

2C
   PrAwCEL 
   PrACCgL 
   PEAwCgL 
3C
   PrAwCgL 

算法

他的是我代码的一部分，所以我将解释我的算法

1.我读了突变文件，其中有三个字符是eg E2R，其中Eis氨基酸字母是输入序列PEACCEL的2个位置，第三个字母R是E2将是R

2.所以首先我从用户突变文件中提取位置和第三个变量，并将它们存储到变量SecNum和mutateSidueThirdChar中

3.然后，我使用循环按索引读取sequencePEACCEL，然后选择与SecNUmE2,4,6匹配的索引，我将这些序列替换为带有突变残基的序列，突变残基是突变文件2R，4W，6G中的第三个字符

---

4.最后，我通过这行代码将突变的残基索引和其他残基连接起来：new=序列[:index]+AfterMutate+序列[index+1:]

提前谢谢

from itertools import combinations,chain
from collections import Counter


def Mutation(SEQUENCES,conA):
    
    #mutations=map(lambda x:x.strip(),open('a.txt','r').readlines())
    
    mutation_combinations= chain.from_iterable([list(combinations(conA,i))for i in range(1,4)])
    #[('E2R',), ('C4W',), ('E6G',), ('E2R', 'C4W'), ('E2R', 'E6G'), ('C4W', 'E6G'), ('E2R', 'C4W', 'E6G')]
    
    for i in mutation_combinations:
        print "combination :"+'_'.join(i)
        c=Counter({})
        temp_string=SEQUENCES
        for j in i:
            c[j[1]]=j[2].lower()
        for index,letter in c.items():
            temp_string=temp_string[:int(index)-1]+letter+temp_string[int(index):]
        print temp_string

输出 我遵循的算法是：

阅读突变序列，如E2R。。。。从使用mutations=maplambda x:x.strip的文件中，打开'a.txt'，'r'

使突变的组合变为突变组合=链。从_iterable[ListCombinationsStations，ifor i in range 1,4]如果有4个突变，则希望所有4个突变都将范围值更改为5

所以对于每个组合，我都用指定的字符替换它们

for j in i:
    c[j[1]]=j[2].lower()

---

我使用上面的计数器跟踪在变异组合过程中要替换的字符

感谢您的快速回复：这是我代码的一部分，因此我将解释我的算法1。我读取了突变文件，其中有三个字符用于eg E2R，其中Eis氨基酸字母是输入序列PEACCEL的2个位置，第三个字母R是E2将是R。因此，首先我从用户突变文件中提取位置和第三个变量，并将其存储到变量SecNum和mutateSiduethirdchar中。然后，我使用循环按索引读取序列PEACCEL，然后选择与SecNUmE2,4,6匹配的索引，我将这些序列替换为带有突变残基的序列，突变残基是突变文件2R，4W，6G中的第三个字符。最后，我通过这行将突变残基索引与其他残基连接起来：new=序列[：索引]+AfterMutate+序列[index+1:]对不起，亲爱的朋友sundar natarajСааааа，因为我正在编辑，所以上次看不到您的回复。这是通知你们，我的主要目标是从一个突变文件中做出2，3个组合，它有三行请接受问题，我的联系人是iamsundar04@gmail.comI我得到的组合是这样的：组合：E组合：2组合：R组合：组合：C组合：4组合：W组合：组合：E组合组合：6我想这是因为我们需要将这个conA列表更改为字符串对吗？@user3805057是的conA应该像['E2R'，'C4W'，'E6G']我更改了一些修改str=.joinconA-->mut=str.split\n-->mutation\u compositions=chain.from_iterable[listcombinationsmut，I->for I in range 1,4]->对于突变组合中的i:->print>+'''''''''''''''''''''''.joini，我得到的结果如下>E2R>C4W>E6G>E2R\U C4W>E2R\U E6G>C4W_E6G@user3805057您能否只打印conA值，您的方法最终输出中的获取值和序列值如下：>E2R PrACCEL>C4W PEAwCEL>E6G PEACCgL>E2R_C4W PrACCELPrACCEL PrACCEL>E2R_E6G PrACCEL PrACCEL PrACCEL>C4W_E6G Peaccel Peaccel Peaccel>E2R_C4W_E6G PrACCEL PrACCEL PrACCEL PrACCEL PrACCEL PrACCEL PrACCEL>E2R_C4W_E6; PrACCEL PrACCEL PrACCEL PrACCEL PrACCEL>E2R_E6G PrACCEL PrACCEL>C4W_E6G峰值>E2R_C4W_E6G峰值

for j in i:
    c[j[1]]=j[2].lower()