Python dna补体中的关键错误

这里的错误是文件

import string
import os,sys

file=open("C:\Python27\\New Text Document.txt",'r')\
seq =file.readlines() basecomplement = {'A': 'T', 'C': 'G', 'G': 'C', 'T': 'A'}

def translate(seq):
    aaseq = []
    for str in seq:
       aaseq.append(basecomplement[str])
    return aaseq

for frame in range(1):
    rseqn= (''.join(item.split('|')[0] for item in translate(seq[frame:])))

rseqn = rseqn[::-1]    
print(rseqn)
print(seq) 

---

如果我使用简单字符串，我也会获得序列，但我试图将文件作为输入读取，如果我理解您试图获取的内容，则会显示以下错误

"C:\Users\ram\Desktop\pythonhw\dnacomp.py", line 13, in <module>
rseqn= (''.join(item.split('|')[0] for item in
translate(seq[frame:])))   File

"C:\Users\ram\Desktop\pythonhw\dnacomp.py", line 10, in translate
aaseq.append(basecomplement[str]) KeyError:
'AGTCTGGCATACCAGTACAGACTATCA'

测试

def translate(seq):
    basecomplement = {'A': 'T', 'C': 'G', 'G': 'C', 'T': 'A'}
    return ''.join(basecomplement[letter] for letter in seq)

要翻译文件，您可以执行以下操作

s = 'ATCGGCATAATAC'
>>> translate(s)
'TAGCCGTATTATG'

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请清理代码！！！我知道我可以用这个函数作为文件输入吗？你能举个例子说明你的文件是什么样子吗？dna文件快速格式如果你想让我在这里粘贴数据，我也可以，我必须在shell或程序中使用这个代码

with open('file.txt', 'r') as f:
    for line in f:
        print(translate(line))