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在Python脚本中嵌入程序

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我创建了一个程序，允许用户输入有关DNA扭曲、旋转和位置的信息以及其他信息。输出是一个PDB文件，但是，我想在程序中的.PDB查看器中显示.PDB文件，似乎不知道如何显示。理想的应用是奇美拉(http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/)，或瑞士(http://spdbv.vital-it.ch/).

根据您希望集成的紧密程度，一个良好的开端可以是使用python从外部调用Chimera或Swiss：

import subprocess
subprocess.Popen(["C:/Path/To/Chimera/bin/chimera.exe", "--stereo",  "seq", "c:/Path/to/pdb/you/created/protease.pdb"])
这将导致一个Chimera窗口弹出打开，然后加载并呈现您的pdb，但让您的应用处于活动状态并在后台运行（如果您希望您的程序等待外部程序关闭，请使用
子流程。调用
）

（顺便说一句，子流程是实现这一点的较新方法。
os.system
和
os.exec*
是不推荐的方法，但仍然会得到类似的结果。）