Python skbio模块的设计

我正在运行Python3并安装了skbiov0.5.5。按照中的示例，我尝试为一些skbio类运行导入语句，但遇到了错误。比如说,

from skbio.alignment import Alignment

导致

ImportError:无法从“skbio.Alignment”导入名称“Alignment”

而且

from skbio import BiologicalSequence

导致

ImportError:无法从“BiologicalSequence”导入名称“Alignment”

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如何解决此问题？

对齐类来自较旧版本的

skbio

库，特别是0.3版之前的版本

如果您想使用这些类，您需要在该版本之前安装scikit bio，方法如下：

pip install scikit-bio==0.2

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如果您正在阅读《应用生物信息学导论》一书，就像您在评论中提到的那样，最好是，哪本书将使用最新版本的scikit生物库。

您使用的是什么版本的skbio？这些在最新版本中似乎不存在。我使用的是skbio版本的0.5.5。但在本教程中，您将看到他们似乎正在运行这些模块。如果答案有助于解决您的问题，请记住接受答案。谢谢非常感谢@Clarence Leung