将链接矩阵转换为树（scipy.cluster.hierarchy.to_tree，python3）

我想将链接矩阵转换为一棵树（进一步将其转换为newick格式）。链接矩阵如下所示：

[[ 0.  1.  1.  2.]
[ 2.  4.  4.  3.]
[ 3.  5.  6.  4.]]

当我运行代码（“从ete3导入树”）时：

程序在item2node处终止，并显示错误消息：

异常“未处理的类型错误”
不可损坏类型：“ClusterNode”

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有什么想法吗？

你不能用

t

作为字典的钥匙。它不是可散列对象。不能将

t

用作字典的键。它不是可散列对象。

T = scipy.cluster.hierarchy.to_tree(Z)
root = Tree()
root.dist = 0
root.name = "root"
item2node = {T: root}