Python编程
我的作业要求进行函数调用readFasta 接受 1 论据： 这个 名称 属于 A. 法斯塔 格式 文件 （fn） 包含 1 或 更多 序列。 这个 作用 应该 阅读 这个 文件 和 返回 A. 字典 哪里 这个 钥匙 是 这个 法斯塔 标题 及 这个 价值观 是 这个 相应的 序列 从…起 文件 fn 转换 到 串。 制作 当然 那个 你 不要 包括 任何 新的 线 或 其他 空白 人物 在里面 这个 序列 在里面 这个 字典 对于ex，如果afile.fa看起来像：Python编程,python,Python,我的作业要求进行函数调用readFasta 接受 1 论据： 这个 名称 属于 A. 法斯塔 格式 文件 （fn） 包含 1 或 更多 序列。 这个 作用 应该 阅读 这个 文件 和 返回 A. 字典 哪里 这个 钥匙 是 这个 法斯塔 标题 及 这个 价值观 是 这个 相应的 序列 从…起 文件 fn 转换 到 串。 制作 当然 那个 你 不要 包括 任何 新的 线 或 其他 空白 人物 在里面 这个 序列 在里面 这个 字典 对于ex，如果afile.fa看起来像
>one
atctac
>two
gggaccttgg
>three
gacattac
import gzip
def readFasta(fn):
if fn.endswith('.gz'):
fh = gzip.gzipfile(fn)
else:
fh = open(fn,'r')
d = {}
while 1:
line = fh.readline()
if not line:
fh.close()
break
vals = line.rstrip().split('\t')
number = vals[0]
sequence = vals[1]
if d.has_key(number):
lst = d[number]
if gene not in lst:
# this test may not be necessary
lst.append(sequence)
else:
d[number] = [sequence]
return d
你的帖子有点让人困惑。我假设您希望它返回一个dict。在这种情况下，您将把它写成
{'one'：'actg'，'two'：'aaccttgg'}import gzip
def read_fasta(filename):
with gzip.open(filename) as f:
return dict(line.split() for line in f)
你的帖子有点让人困惑。我假设您希望它返回一个dict。在这种情况下，您将把它写成
{'one'：'actg'，'two'：'aaccttgg'}import gzip
def read_fasta(filename):
with gzip.open(filename) as f:
return dict(line.split() for line in f)
你可能会有更好的运气，因为它更适合生物信息学类型的问题。你应该重新格式化你的代码。突出显示代码并按带有数字的图标。我正在尝试编辑格式，它在预览中正确显示，但我的更改只影响
import gzipimport gzip