Python 如何抑制rpy2中的错误消息

以下代码不起作用。似乎R警告消息引发了一个python错误

# enable use of python objects in rpy2
import rpy2.robjects.numpy2ri
import numpy as np
from rpy2.robjects import r

# create an example array
a = np.array([[5,2,5],[3,7,8]])

# this line leads to a warning message, which in turn raises an 
# error message if run within a script.
result = r['chisq.test'](a)

在ipython中运行该代码示例是可行的，但是，在脚本中运行它会引发errorTypeError:“module”对象不可订阅。我想这是由于警告信息

避免此问题的最佳方法是什么？

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提前谢谢

将打印语句放在错误之前：

print(r)
result = r['chisq.test'](a)

错误消息

TypeError:“module”对象不可订阅

声称

r

正在引用模块。当您使用print语句运行脚本时，您将看到如下内容

<module 'rpy2' from '/usr/lib/python2.6/dist-packages/rpy2/__init__.pyc'>
Traceback (most recent call last):
  File "/home/unutbu/pybin/test.py", line 14, in <module>
    result = r['chisq.test'](a)
TypeError: 'module' object is unsubscriptable

---

然后第二条import语句覆盖第一条，名称

r

随后引用模块

rpy2

，而不是

rpy2.robjects.r

谢谢你为我指明了正确的方向。我更改了导入语句，现在代码正确运行了。@Björn:没问题！很高兴这有帮助。

from rpy2.robjects import r
...
import rpy2 as r