Python 读入多个hdf5文件并将其附加到新词典

我有一个

hdf5

文件列表，我想打开这些文件，并将相应的值读入一个新字典，最终写入一个文本文件。我不一定知道这些值，所以用户在数组中定义它们作为代码的输入。所需文件的数量由用户希望查看的数据天数定义

new_data_dic = {}

for j in range(len(values)):
    new_data_dic[values[j]] = rbsp_ephm[values[j]]
for i in (np.arange(len(filenames_a)-1)+1):
        rbsp_ephm = h5py.File(filenames_a[i])
        for j in range(len(values)):
            new_data_dic[values[j]].append(rbsp_ephm[values[j]])

如果我只有一个文件，这很好，但是如果我有两个或更多文件，它似乎会关闭密钥？我不确定这是否就是正在发生的事情，但当我问新的数据dic是什么时，对于它给出的值，

{'Bfs_geo_a'：，…

，它不会写入文本文件。我尝试在打开下一个（

rbsp_ephm.close（）

）之前关闭hdf5文件，但我得到了相同的错误

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感谢所有帮助！

可能不是好的解决方案，但您可以尝试将数据提取为numpy数组，这是一种比h5py数据集更灵活的格式。请参见下面的操作方法：

>>> print type(file['Average/u'])
<class 'h5py.highlevel.Dataset'>
>>> print type(file['Average/u'][:])
<type 'numpy.ndarray'>

而不是：

for j in range(len(values)):
    new_data_dic[values[j]] = rbsp_ephm[values[j]]

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我真的不明白您的问题…您正在尝试创建hdf5数据集的列表？ 还是您忘记了使用

[（）]

来访问数据集本身中的值

下面是一个简单的独立示例，效果很好：

import h5py

# File creation 
filenames_a = []
values = ['values/toto', 'values/tata', 'values/tutu']

nb_file = 5
tmp = 0
for i in range(nb_file):
    fname = 'file%s.h5' % i
    filenames_a.append(fname)
    file = h5py.File(fname, 'w')
    grp = file.create_group('values')
    for value in values:
        file[value] = tmp
        tmp += 1
    file.close()

# the thing you want
new_data_dict = {value: [] for value in values}

for fname in filenames_a:
    rbsp_ephm = h5py.File(fname, 'r')
    for value in values:
        new_data_dict[value].append(rbsp_ephm[value][()])

print new_data_dict

它返回：

{'values/tutu': [2, 5, 8, 11, 14], 'values/toto': [0, 3, 6, 9, 12], 'values/tata': [1, 4, 7, 10, 13]}

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它回答了您的问题吗？

我正试图从hdf5文件中获取数据并将其放入字典中打开一个新文件并获取该数据，然后将其附加到字典中已有的数据中。似乎发生的情况是，如果您有一个文件，它就可以正常工作，但当您打开第二个文件时，第一个文件就会关闭并被遗忘不，如果你认为这只是在你做

rbsp_ephm[values[j]]

的时候，它不是你处理的实际数据（它是

HDF5数据集

对象），你必须做

rbsp_ephm[values[j][（）]

。试着打印这两个数据以确保。。。

{'values/tutu': [2, 5, 8, 11, 14], 'values/toto': [0, 3, 6, 9, 12], 'values/tata': [1, 4, 7, 10, 13]}