如何修复此python%s占位符排列

我需要遍历输入文件对R1和R2，这两个文件将一起处理，每个文件都附加一个“.trim”文件扩展名

我对python和glob的了解有限，它们在使用成对输入但使用单个输出的类似任务中工作得很好。我完全不明白为什么这不起作用，尽管我相信这是一个简单的解决办法

#/usr/bin/python
导入glob
导入操作系统
files=glob.glob（“ATAC*R1*.fastq.gz”）
对于ifile in文件：
操作系统（“cutadapt-一个CTGTCTCTTACACATCT-一个CTGTCTTACACATCT-一个AGATGTTAAAGAGA-o%s.trim-p%s.trim%s%s”%（ifile，ifile.replace（“R1”，“R2”），ifile，ifile.replace（“R1”，“R2”））

这项工作应如下：

ATAC2-1_R1_.fastq.gz and ATAC2-1_R1_.fastq.gz -> ATAC2-1_R1_.fastq.gz.trim and ATAC2-1_R1_.fastq.gz.trim. 

---

我想迭代几个R1和R2对。感谢您的帮助！

与其尝试使用%s占位符，不如尝试使用.format（），如下所示：

"cutadapt -a CTGTCTCTTATACACATCT -A CTGTCTCTTATACACATCT -a AGATGTGTATAAGAGA -o {0}.trim -p {1}.trim {2} {3}".format(ifile, ifile.replace("R1","R2"), ifile, ifile.replace("R1","R2"))

---

唯一的问题是缺少结尾括号：

    os.system("cutadapt -a CTGTCTCTTATACACATCT -A CTGTCTCTTATACACATCT -a AGATGTGTATAAGAGA -o %s.trim -p %s.trim %s %s" % (ifile, ifile.replace("R1","R2"), ifile, ifile.replace("R1","R2")))

---

您只需要添加结尾括号，就应该停止出现语法错误。

我认为脚本的最后一行有一个非打印字符。您认为问题与

%s

占位符有关吗？错误消息说它在第7行，但占位符在第6行。通常是Python用

^

显示一个指向语法错误的指针。这真的是整个错误消息吗？感谢您的快速回复！我愚蠢地漏掉了一个未被注意到的括号。感谢您提供了另一个选择。这将是一个很好的练习方法！不要发布打字问题的真实答案，只需发布一条评论。答案会减慢速度胡佛删除了不好的问题。

    os.system("cutadapt -a CTGTCTCTTATACACATCT -A CTGTCTCTTATACACATCT -a AGATGTGTATAAGAGA -o %s.trim -p %s.trim %s %s" % (ifile, ifile.replace("R1","R2"), ifile, ifile.replace("R1","R2")))