Python 在bash中过滤文本文件的某些部分时出现问题

我有一个类似于小示例的文件： 小例子：

>ENSG00000004142|ENST00000003607|POLDIP2|||2118
Sequence unavailable
>ENSG00000003056|ENST00000000412|M6PR|9099001;9102084|9099001;9102551|2756
CCAGGTTGTTTGCCTCTGGTCGGAAAGGGAAACTACCCCTGCTTCCACTCTGACAGCAGA

但我有太多的“序列不可用”。我想扔掉那些成绩单。结果是这样的：

>ENSG00000003056|ENST00000000412|M6PR|9099001;9102084|9099001;9102551|2756
CCAGGTTGTTTGCCTCTGGTCGGAAAGGGAAACTACCCCTGCTTCCACTCTGACAGCAGA

我尝试使用

grep -A 2 "Sequence" your.fa | grep -v "\-\-" | sed -n '/Sequence/!p' > new.fa

但它只是删除了“Sequence unavailable”（序列不可用），而不是它的标题（在每个序列上方的行以

“>”

开头，它是每个序列的标识符）

---

如何在bash或python中过滤掉它们？

假设包含

序列不可用的行以及上面的行应该被删除，可以使用以下sed：

$ sed '$!N;/\nSequence unavailable$/d;P;D' input

基本上，它的工作原理是一次将两行读入模式空间，然后打印最上面的一行，然后将其从模式空间中删除，从而将当前行保留在模式空间中，这会导致始终落后一行：

$!N;                               # Append Next line to pattern space unless
                                   # there are no more lines
    /\nSequence unavailable$/d     # Delete whole pattern space if regex is matched
                               P;  # Print first line of pattern space
                                 D # Delete first line of pattern space

以上在GNU sed中工作，可能需要更改
；D
用于
；$！Dq
要使用严格的POSIX sed，否则将有一个无止境的循环。
假设包含
序列不可用的行以及上面的行都应该删除，可以使用此sed：

$ sed '$!N;/\nSequence unavailable$/d;P;D' input

基本上，它的工作原理是一次将两行读入模式空间，然后打印最上面的一行，然后将其从模式空间中删除，从而将当前行保留在模式空间中，这会导致始终落后一行：

$!N;                               # Append Next line to pattern space unless
                                   # there are no more lines
    /\nSequence unavailable$/d     # Delete whole pattern space if regex is matched
                               P;  # Print first line of pattern space
                                 D # Delete first line of pattern space

以上在GNU sed中工作，可能需要更改
；D
用于
；$！Dq
要使用严格的POSIX sed，否则将有一个无休止的循环。
如果要删除整行，请使用
grep-v“Sequence unavailable”
。使用上述代码，我可以删除整行。但是我还想删除上面的一行，这是它的标识符。是否总是在
序列不可用的上面有一行需要删除？是的。例如，如果要删除整行，请使用
grep-v“Sequence unavailable”
。使用上面提到的代码，我可以删除整行。但是我还想删除上面的一行，这是它的标识符。是否总是在
序列不可用的上面有一行需要删除？是的。例如