Python 在matplotlib中动态更新绘图
我正在用Python制作一个应用程序,它从一个串行端口收集数据,并根据到达时间绘制收集的数据图。数据的到达时间是不确定的。我希望在收到数据时更新绘图。我搜索了如何做到这一点,找到了两种方法:Python 在matplotlib中动态更新绘图,python,matplotlib,tkinter,Python,Matplotlib,Tkinter,我正在用Python制作一个应用程序,它从一个串行端口收集数据,并根据到达时间绘制收集的数据图。数据的到达时间是不确定的。我希望在收到数据时更新绘图。我搜索了如何做到这一点,找到了两种方法: 清除绘图,然后重新绘制包含所有点的绘图 通过在特定间隔后更改来设置绘图动画 我不喜欢第一个,因为程序运行和收集数据的时间很长(例如一天),重新绘制绘图会非常慢。 第二种方法也不可取,因为数据到达的时间不确定,我希望绘图仅在收到数据时更新 是否有一种方法可以仅在收到数据时向绘图添加更多点来更新绘图 是否有一种
数据
属性,因此不需要清除屏幕或图形。可以简单地扩展数据
属性,这样您就可以保留以前的点,只需继续添加到直线(或图像或正在绘制的任何对象)中即可
鉴于您说您的数据到达时间不确定,您最好的选择可能是执行以下操作:
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy
hl, = plt.plot([], [])
def update_line(hl, new_data):
hl.set_xdata(numpy.append(hl.get_xdata(), new_data))
hl.set_ydata(numpy.append(hl.get_ydata(), new_data))
plt.draw()
然后,当您从串行端口接收数据时,只需调用
update\u line
即可,这样做不需要动画(例如,您希望在生成绘图时执行代码的其他部分,或者希望同时更新多个绘图),单独调用draw
不会生成绘图(至少使用qt后端)
以下是我的作品:
import matplotlib.pyplot as plt
plt.ion()
class DynamicUpdate():
#Suppose we know the x range
min_x = 0
max_x = 10
def on_launch(self):
#Set up plot
self.figure, self.ax = plt.subplots()
self.lines, = self.ax.plot([],[], 'o')
#Autoscale on unknown axis and known lims on the other
self.ax.set_autoscaley_on(True)
self.ax.set_xlim(self.min_x, self.max_x)
#Other stuff
self.ax.grid()
...
def on_running(self, xdata, ydata):
#Update data (with the new _and_ the old points)
self.lines.set_xdata(xdata)
self.lines.set_ydata(ydata)
#Need both of these in order to rescale
self.ax.relim()
self.ax.autoscale_view()
#We need to draw *and* flush
self.figure.canvas.draw()
self.figure.canvas.flush_events()
#Example
def __call__(self):
import numpy as np
import time
self.on_launch()
xdata = []
ydata = []
for x in np.arange(0,10,0.5):
xdata.append(x)
ydata.append(np.exp(-x**2)+10*np.exp(-(x-7)**2))
self.on_running(xdata, ydata)
time.sleep(1)
return xdata, ydata
d = DynamicUpdate()
d()
我知道我回答这个问题已经晚了,但对于您的问题,您可以查看“操纵杆”软件包。我设计它是为了从串行端口打印数据流,但它适用于任何流。它还允许交互式文本记录或图像打印(除了图形打印)。 无需在单独的线程中执行自己的循环,软件包会处理它,只需提供您希望的更新频率。此外,终端在打印时仍可用于监视命令。 请参阅或(使用pip安装操纵杆进行安装) 只需将np.random.random()替换为从串行端口读取的实际数据点,代码如下:
import joystick as jk
import numpy as np
import time
class test(jk.Joystick):
# initialize the infinite loop decorator
_infinite_loop = jk.deco_infinite_loop()
def _init(self, *args, **kwargs):
"""
Function called at initialization, see the doc
"""
self._t0 = time.time() # initialize time
self.xdata = np.array([self._t0]) # time x-axis
self.ydata = np.array([0.0]) # fake data y-axis
# create a graph frame
self.mygraph = self.add_frame(jk.Graph(name="test", size=(500, 500), pos=(50, 50), fmt="go-", xnpts=10000, xnptsmax=10000, xylim=(None, None, 0, 1)))
@_infinite_loop(wait_time=0.2)
def _generate_data(self): # function looped every 0.2 second to read or produce data
"""
Loop starting with the simulation start, getting data and
pushing it to the graph every 0.2 seconds
"""
# concatenate data on the time x-axis
self.xdata = jk.core.add_datapoint(self.xdata, time.time(), xnptsmax=self.mygraph.xnptsmax)
# concatenate data on the fake data y-axis
self.ydata = jk.core.add_datapoint(self.ydata, np.random.random(), xnptsmax=self.mygraph.xnptsmax)
self.mygraph.set_xydata(t, self.ydata)
t = test()
t.start()
t.stop()
以下是一种允许在绘制一定数量的点后删除点的方法:
import matplotlib.pyplot as plt
# generate axes object
ax = plt.axes()
# set limits
plt.xlim(0,10)
plt.ylim(0,10)
for i in range(10):
# add something to axes
ax.scatter([i], [i])
ax.plot([i], [i+1], 'rx')
# draw the plot
plt.draw()
plt.pause(0.01) #is necessary for the plot to update for some reason
# start removing points if you don't want all shown
if i>2:
ax.lines[0].remove()
ax.collections[0].remove()
最后!我一直在寻找这个问题的答案+1:)我们如何使绘图自动重新缩放。ax.set_autoscale_on(True)似乎不起作用。找到了答案:更新数据后,调用ax.relim()然后调用ax.autoscale_view(),但在调用plt.draw()之前,指向Matplotlib cookbook()的链接似乎已断开(我得到了“禁止”错误),因为没有调用show(),所以绘图永远不会出现在屏幕上。如果我调用show(),它将阻塞并不执行更新。我错过什么了吗?(这个答案有正确的总体思路,但示例代码无法运行)可能重复Yes!最后是一个与Spyder合作的解决方案!我缺少的是draw()命令之后的gcf().canvas.flush_events()。基于这个伟大的示例,我编写了一个允许重复打印的小型Python模块:一个漂亮的示例!清晰、简洁、通用、灵活:这应该是公认的答案。要在Jupyter笔记本中使用此选项,必须在matplotlib导入语句后添加
%matplotlib Notebook
魔术命令。plt.pause(0.01)是我需要的。非常感谢。