Python Subprocess.call或Subprocess.Popen无法使用路径（Linux/Windows）中的可执行文件

我正在编写一个程序，需要在Linux和Windows上运行，并使用路径中存在的可执行文件（带参数）。（假定）

目前，我在windows中使用Subprocess.Call和Subprocess.Popen运行可执行文件时遇到问题

对于这样的代码，在windows 8中

def makeBlastDB(inFile, inputType, dbType, title, outDir):
    strProg = 'makeblastdb'
    strInput = '-in ' + inFile
    strInputType = '-input_type ' + inputType
    strDBType = '-dbtype ' + dbType
    strTitle = '-title ' + title
    strOut = '-out ' + os.path.join(os.sep, outDir, title)
    cmd = [strProg, strInput, strInputType, strDBType, strTitle, strOut]
    result = Popen(cmd, shell=True)

我在控制台中得到错误消息

'makeblastdb' is not recognized as an internal or external command,
operable program or batch file.

即使我可以使用cmd.exe运行相同的命令 我得到了与shell=False相同的响应

---

假设可执行文件在PATH环境变量中，我如何运行该命令？谢谢

您可以通过传递带有

env

关键字参数的映射来控制生成的子流程中可用的环境变量。例如

proc = subprocess.Popen(args, env={'PATH': '/some/path'})

或者从系统环境变量继承

PATH

，而不必从系统环境中插入其他所有内容：

proc = subprocess.Popen(args, env={'PATH': os.getenv('PATH')})

---

不过，仅仅使用绝对路径可能更容易/更简单。

好的，下面是我如何让它工作的

env = os.environ
proc = subprocess.Popen(args, env=env)

---

我自己也在挣扎，直到我发现

---

“如果在Windows上将目录添加到PATH中，使目录以引号括起来，则子进程在其中找不到可执行文件。”由于Windows不需要引号，因此删除引号可以修复我的问题（在2.7中）。

我的一位同事在Windows 10 64位上用Python 3.6.5重现了这个问题

然而，Python的安装版本是32位的

---

重新安装64位版本的Python修复了此问题。

只需编写一个简单的脚本，将可执行文件添加到路径中，或者您可以提供可执行文件的完整路径。我不想这样做，因为可执行文件是第三方的，这意味着它可以安装在任何地方。它在shell中工作吗？你有没有比较过

echo%PATH%

和

os.environ['PATH']

？@J.F.Sebastian这个问题已经问了3年多了，OP已经以某种方式解决了他们的问题（答案可疑），我不确定你会从这里得到更多信息……；）这可能是一个不同的cwd，也可能是一些糟糕的windows怪癖，因为公认的答案没有多大意义。@wim:如果OP不更新这个问题，那么它应该被关闭为不可复制（因为显然

subprocess.Popen

可以运行（至少一些）Linux和windows上路径中的可执行文件）。谢谢。至于绝对路径，因为程序可能会在已经安装了.exe的机器上运行，所以我不想费事手动查找.exe。对我来说不起作用。如果我找到了解决方案，我会稍后再回答这个问题。第二个例子中有一个错误

os.environ（）['PATH']

应替换为

os.environ['PATH']

@WyattBaldwin谢谢，已修复。以后您可以自己直接编辑答案。

env={'PATH'：os.getenv（'PATH'）}

似乎没有用（路径还是继承的），甚至在孩子可能需要其他环境变量时有害。如果OP知道路径；OP可以传递完整路径（包括文件扩展名）（在

args[0]

中）。如果我没有弄错的话，这不会产生任何净效果，因为“Popen的默认行为是]继承当前进程的环境”。@WyattBaldwin：你没有弄错。很容易检查、运行：

Popen（[sys.executable，'-c'，import os；print（os.environ）'））

，以查看环境是否被继承。如果要修改子环境，您可能需要传递

env

：

env=dict（os.environ，ENVVAR='visible in only in child'）

有趣-这可能解释了为什么添加shell=True似乎常常能解决此问题。