R 合并两个数据帧和vlookup

我有两个数据帧（df1，df2）。我希望将它们结合起来，这样，如果特定样本ID的基因存在于df1中，我希望它在df2中相应的匹配基因列和样本ID行中被分配“1”（存在）。如果基因不存在于df1中，它将自动填充df2，并带有“0”（缺失），如下面的结果数据框所示。非常感谢您在这方面的帮助。提前感谢您

df1

df2

结果

+-----+---+---+---+---+
| ID  | A | B | C | D |
+-----+---+---+---+---+
| 100 | 1 | 1 | 0 | 0 |
| 101 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| 102 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| 103 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| 104 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| 105 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| 106 | 0 | 0 | 0 | 0 |
+-----+---+---+---+---+

---

不需要合并。

df1

的简单长到宽转换就足够了：

df1%>%mutate（n=1）%%>%spread（Gene.name，n，fill=0）

或

reforme2:：dcast（transform（df1，n=1），ID~Gene.name，fill=0）

。有关更多选项，请参见dupe target链接。注意：我经常看到以这种方式显示的示例数据。通常这不是一种好方法，因为我们无法轻松地将数据复制粘贴到R终端（这需要我们去掉多余和不必要的“边框字符”）。有没有一种特殊的工具可以以这种方式输出数据？我希望你不要花时间手工格式化数据？在这种情况下，请不要：-）谢谢毛里兹，非常感谢。抱歉，我不清楚，但我想包括df2的原因是，并非所有样本都有与之相关的基因。例如，df1没有提到Sample 106，那么我如何确保在我的输出中，样本106对于所有不同的基因都得到“0”？关于你的第二个问题，不幸的是，我接收原始数据的方式是，我必须“手工”格式化。基本上，我得到了“基因组变体”的列表“如果样本中没有列出某一特定基因，那么假设该基因中不存在任何变异，这是不正常的吗？”？有更好的方法吗？关于你的第一个问题，我会用

complete

来填写缺失的级别<代码>基因完成百分比（Gene.name，ID）%%>%扩散（Gene.name，n，fill=0）；根据需要调整

基因

和

ID

。无需合并。对

df1

进行简单的长到宽转换就足够了：

df1%>%突变（n=1）%%>%扩散（Gene.name，n，fill=0）

或

restrape2:：dcast（transform（df1，n=1），ID~Gene.name，fill=0）

。请参阅dupe target链接以了解更多选项。PS和稍微偏离主题的说明：我经常看到以这种方式显示的示例数据。一般来说，这不是一个好方法，因为我们无法轻松地将数据复制粘贴到R终端（它要求我们去掉多余和不必要的“边框字符”）。是否有一种特殊的工具以这种方式输出数据？我希望您不要花时间手动格式化这样的数据？在这种情况下，请不要：-）谢谢毛里塔尼亚，非常感谢。抱歉，我不清楚，但我想包括df2的原因是，并非所有样本都有与之相关的基因。例如，df1没有提到样本106，那么我如何确保在我的输出中样本106对于所有不同的基因都得到一个“0”呢？关于你的第二个问题，不幸的是，我接收原始数据的方式是，我必须“手工”格式化。基本上，我得到了一个异常的“基因组变异”列表，如果样本中没有列出特定的基因，那么假设该基因中不存在变异？有更好的方法吗？关于你的第一个问题，我会用

complete

来填写缺失的级别<代码>基因完成百分比（Gene.name，ID）%%>%扩散（Gene.name，n，fill=0）；根据需要调整基因和ID。

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| ID  | A | B | C | D |
+-----+---+---+---+---+
| 100 |   |   |   |   |
| 101 |   |   |   |   |
| 102 |   |   |   |   |
| 103 |   |   |   |   |
| 104 |   |   |   |   |
| 105 |   |   |   |   |
| 106 |   |   |   |   |
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| ID  | A | B | C | D |
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| 100 | 1 | 1 | 0 | 0 |
| 101 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| 102 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| 103 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| 104 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| 105 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| 106 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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